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Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie
Actualités

Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie

Contrairement aux pandémies bien documentées comme celles de la peste noire, qui a persisté pendant près d'un demi-millénaire et qui a décimé la moitié de la population européenne, il n'y a pas de registres historiques permettant d'étudier l'impact causé par des bactéries responsables d'épidémies beaucoup plus circonscrites. Ainsi, on ne sait pas vraiment de combien de morts sont responsables des pathogènes tels qu'Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ou Staphylococcus aureus, bien qu'ils soient probablement liés à plusieurs millions de décès dans l'histoire.

Une bactérie commensale

Une des raisons expliquant cette anomalie tient au fait que la plupart de ces germes sont commensaux, c'est-à-dire qu'ils vivent en bonne intelligence avec leur hôte, dans ce cas l'humain. E.coli est, par exemple, présente dans l'intestin de tous les mammifères et de nombreux vertébrés, là aussi sans provoquer, la plupart du temps, de dégâts. Néanmoins, certaines souches de cette bactérie sont responsables d'intoxications alimentaires parfois sévères pouvant évoluer en septicémie ; elles affectent tout particulièrement les personnes les plus fragiles : vieillards, immunodéprimés ou jeunes enfants. L'actualité récente en a encore fait état avec le scandale des pizzas Buitoni. Une part de la gravité des infections à E.coli tient à la capacité de cette bactérie de résister aux traitements habituels, la fameuse "résistance aux antibiotiques". Comprendre comment cette ou plutôt ces résistances ont été acquises permettraient aux médecins de mieux cibler les traitements et donc soigner les malades. D'où l'intérêt de disposer de souches anciennes datant d'avant l'époque d'Alexander Fleming, le découvreur de la pénicilline.

Des nobles momifiés

C'est une telle souche, vieille de 400 ans, qui a été identifiée dans une momie italienne. Elle appartient à un groupe de nobles italiens dont les corps bien conservés ont été retrouvés à l'abbaye de Saint Domenico Maggiore, à Naples, en 1983. Pour l'étude, les chercheurs de l'Université McMaster, au Canada, et de l'Université Paris Cité ont effectué une analyse détaillée de l'un des individus, Giovani d'Avalos. Noble napolitain de la Renaissance, il avait 48 ans lorsqu'il mourut en 1586. L'individu souffrait d'une cholécystite chronique, une inflammation de la vésicule biliaire (dans le foie), provoquée par des calculs. Ces petits cailloux, qui provoquent de fortes douleurs, ont été analysés par Erick Denamur, spécialiste de la génétique des populations d’E.coli. Et le chercheur y a retrouvé des fragments de la bactérie, vieux de plus de 400 ans donc. "C’était tellement émouvant de typer cet ancien E. coli et de découvrir qu’il était presque unique mais qu’il s’inscrivait dans une lignée phylogénétique caractéristique des commensaux humains qui causent aujourd’hui des cholécystites", raconte-t-il dans un communiqué.

Des analyses et de la reconstruction du génome de cette bactérie ancestrale, il ressort que ses 4.446 gènes appartiennent au phylogroupe A et à une séquence exceptionnellement rare de type 4995. Elle ne possède pas de facteur de virulence spécifique ni de résistance acquise aux antibiotiques. En revanche, certains des gènes pouvant induire cette résistance sont déjà présents dans cette souche, indique l'étude publiée dans la revue Communications Biology. Le phylogroupe A est généralement présent dans l'intestin d'individus vivant dans des zones rurales ou des communautés peu urbanisées. Il est aussi fréquemment retrouvé dans les cas d'infections biliaires. Selon les chercheurs, il s'agit donc d'un germe opportuniste qui a affecté le foie de ce noble italien, profitant d'une circonstance immunitaire non élucidée.

Ce n'est pas la seule bactérie retrouvée : des fragments de Klebsiella aerogenes ont également été identifiés. Les deux germes auraient même échangé des gènes durant leur cohabitation dans les voies biliaires de Giovani d'Avalos. "Notre reconstruction de cet ancien E. coli aide à dépeindre une image plus complète du fardeau des infections opportunistes dans le passé", expliquent les chercheurs. Mais cette recherche permet aussi d'avoir un point de comparaison pour l'étude des évolutions des génomes des différentes souches d'E.coli et peut-être même de prédire leurs évolutions futures "en termes de virulence et de résistance et peut-être aussi celles d’autres pathogènes opportunistes", concluent les auteurs.


Source :  Joël Ignasse / Sciences et Avenir
Crédit :  Division de Paléopathologie de l'Université de Pise.

Une momie italienne du 16e siècle d'où a été extrait des fragments d'ADN d'E.coli.

Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie Actualités

Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie

Contrairement aux pandémies bien documentées comme celles de la peste noire, qui a persisté pendant près d'un demi-millénaire et qui a décimé la moitié de la population européenne, il n'y a pas de registres historiques permettant d'étudier l'impact causé par des bactéries responsables d'épidémies beaucoup plus circonscrites. Ainsi, on ne sait pas vraiment de combien de morts sont responsables des pathogènes tels qu'Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ou Staphylococcus aureus, bien qu'ils soient probablement liés à plusieurs millions de décès dans l'histoire.

Une bactérie commensale

Une des raisons expliquant cette anomalie tient au fait que la plupart de ces germes sont commensaux, c'est-à-dire qu'ils vivent en bonne intelligence avec leur hôte, dans ce cas l'humain. E.coli est, par exemple, présente dans l'intestin de tous les mammifères et de nombreux vertébrés, là aussi sans provoquer, la plupart du temps, de dégâts. Néanmoins, certaines souches de cette bactérie sont responsables d'intoxications alimentaires parfois sévères pouvant évoluer en septicémie ; elles affectent tout particulièrement les personnes les plus fragiles : vieillards, immunodéprimés ou jeunes enfants. L'actualité récente en a encore fait état avec le scandale des pizzas Buitoni. Une part de la gravité des infections à E.coli tient à la capacité de cette bactérie de résister aux traitements habituels, la fameuse "résistance aux antibiotiques". Comprendre comment cette ou plutôt ces résistances ont été acquises permettraient aux médecins de mieux cibler les traitements et donc soigner les malades. D'où l'intérêt de disposer de souches anciennes datant d'avant l'époque d'Alexander Fleming, le découvreur de la pénicilline.

Des nobles momifiés

C'est une telle souche, vieille de 400 ans, qui a été identifiée dans une momie italienne. Elle appartient à un groupe de nobles italiens dont les corps bien conservés ont été retrouvés à l'abbaye de Saint Domenico Maggiore, à Naples, en 1983. Pour l'étude, les chercheurs de l'Université McMaster, au Canada, et de l'Université Paris Cité ont effectué une analyse détaillée de l'un des individus, Giovani d'Avalos. Noble napolitain de la Renaissance, il avait 48 ans lorsqu'il mourut en 1586. L'individu souffrait d'une cholécystite chronique, une inflammation de la vésicule biliaire (dans le foie), provoquée par des calculs. Ces petits cailloux, qui provoquent de fortes douleurs, ont été analysés par Erick Denamur, spécialiste de la génétique des populations d’E.coli. Et le chercheur y a retrouvé des fragments de la bactérie, vieux de plus de 400 ans donc. "C’était tellement émouvant de typer cet ancien E. coli et de découvrir qu’il était presque unique mais qu’il s’inscrivait dans une lignée phylogénétique caractéristique des commensaux humains qui causent aujourd’hui des cholécystites", raconte-t-il dans un communiqué.

Des analyses et de la reconstruction du génome de cette bactérie ancestrale, il ressort que ses 4.446 gènes appartiennent au phylogroupe A et à une séquence exceptionnellement rare de type 4995. Elle ne possède pas de facteur de virulence spécifique ni de résistance acquise aux antibiotiques. En revanche, certains des gènes pouvant induire cette résistance sont déjà présents dans cette souche, indique l'étude publiée dans la revue Communications Biology. Le phylogroupe A est généralement présent dans l'intestin d'individus vivant dans des zones rurales ou des communautés peu urbanisées. Il est aussi fréquemment retrouvé dans les cas d'infections biliaires. Selon les chercheurs, il s'agit donc d'un germe opportuniste qui a affecté le foie de ce noble italien, profitant d'une circonstance immunitaire non élucidée.

Ce n'est pas la seule bactérie retrouvée : des fragments de Klebsiella aerogenes ont également été identifiés. Les deux germes auraient même échangé des gènes durant leur cohabitation dans les voies biliaires de Giovani d'Avalos. "Notre reconstruction de cet ancien E. coli aide à dépeindre une image plus complète du fardeau des infections opportunistes dans le passé", expliquent les chercheurs. Mais cette recherche permet aussi d'avoir un point de comparaison pour l'étude des évolutions des génomes des différentes souches d'E.coli et peut-être même de prédire leurs évolutions futures "en termes de virulence et de résistance et peut-être aussi celles d’autres pathogènes opportunistes", concluent les auteurs.


Source :  Joël Ignasse / Sciences et Avenir
Crédit :  Division de Paléopathologie de l'Université de Pise.

Une momie italienne du 16e siècle d'où a été extrait des fragments d'ADN d'E.coli.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .

22 - Côtes d'Armor

►Le 20 mars

SORTIE NATURE
"LA NUIT DE LA GRENOUILLE"

Une soirée de découverte des amphibiens, qui se déroule en deux temps : un diaporama en salle suivi d’une sortie de terrain. Une animation destinée à toute la famille pour découvrir la vie aquatique d'une mare et plus particulièrement les amphibiens qui y vivent. Sur réservation uniquement. Informations au 02 96 50 60 04 (place limitées).

Château de la Hunaudaye
22270 Plédéliac
02 96 34 82 10
www.la-hunaudaye.com

25 - Doubs

►Du 1er mai au 14 février 2027

EXPOSITION 
"MYSTIFICATION" - ARCHITECTURE ET CINÉMA, LA QUÊTE DE L’ILLUSION

À une époque où les frontières entre le réel et la fiction sont brouillées, l’architecture et le cinéma se rencontrent pour vous inviter à une expérience visuelle immersive à travers l’art de l’illusion.

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
03 81 54 45 13
www.salineroyale.com

►Du 7 juin au 18 octobre 

FESTIVAL DES JARDINS
"LES INSECTES : LE MONDE DE LA MÉTAMORPHOSE"

Dans les nouveaux jardins du Festival, découvrez un monde visible et fascinant : la beauté des papillons, la mécanique des lucarnes, la cruauté de l’élégante mante religieuse, le vol imposant de l’abeille charpentière ou encore les libellules d’un autre temps…

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
03 81 54 45 13
www.salineroyale.com

38 - Isère

►Le 22 mars

VOYAGE MUSICAL ET SENSORIEL 

Autour de la thématique de la nature et des océans, venez écouter, expérimenter et découvrir les différentes familles d’instruments. Conçu spécialement pour le jeune public accompagné d’un adulte, cet atelier propose une immersion progressive dans l’univers musical à partir d'un conte. 

Musée arcabas en Chartreuse
Eglise de Saint-Hugues
38380 Saint-Pierre-de-Chartreuse
04 76 88 65 01
https://musees.isere.fr

►Jusqu'au 30 mars  

EXPOSITION
"PEINDRE LA LUMIÈRE, DE LA MAQUETTE AU VITRAIL"

Arcabas (1926-2018) s’est intéressé toute sa vie au vitrail qu’il abordait en tant que peintre avant tout. De l'expérience fondatrice de l'église Saint-Hugues aux dernières réalisations du Sacré-Cœur de Grenoble et de Saint-Christophe-sur-Guiers, l’exposition met l’accent sur les maquettes créées par Arcabas et la façon dont elles ont été traduites par les maitres verriers.

Musée arcabas en Chartreuse
Eglise de Saint-Hugues
38380 Saint-Pierre-de-Chartreuse
04 76 88 65 01
https://musees.isere.fr

39 - Jura

►Le 25 mars

CONFÉRENCE
"LA CONTREBANDE DU SEL EN FRANCHE-COMTÉ AU XVIIIᵉ SIÈCLE"

Pour les Nocturnes de l’Histoire, André Ferrer, vous entraîne au cœur de la contrebande du sel en Franche-Comté au XVIIIe siècle. Une conférence passionnante, suivie d’un temps d’échanges. Entrée gratuite. Sur réservation.

Grande Saline de Salins-les-Bains
3 Place des Salines
39110 Salins les Bains
03 84 73 10 92
www.grande-saline.com

42 - Loire

►Le 26 mars

BOURSE D'ÉCHANGES
PARC NATUREL REGIONAL DU PILAT

Le Parc naturel regional du Pilat organise à Jonzieux le jeudi 26 mars 2026 une bourse d échanges de matériel publicitaire des 50 sites cotisant à l'office de tourisme du PARC.
Cette manifestation est une tournante dans des villages différents chaque année depuis l'an 2000.

Contact : 
Musée de la Passementerie
5 rue des passementiers
42660 Jonzieux
04 77 39 93 38
www.maison-passementerie.info

52 - Haute-Marne

►Jusqu'au 19 avril 

EXPOSITION 
"175 ANS DE CRÉATION BRASSICOLEÀ SAINT-DIZIER"

La brasserie du fort carré a été un des fleurons économiques de Saint-Dizier. En activité de 1796 à 1955, elle marqué le paysage urbain de la ville, et est à l’origine de la construction de la Tour Miko. Des techniques de productions de la bière, au nombreux objets publicitaires, l’exposition retracera l’histoire d’une brasserie restée dans les mémoires.

Musée de Saint-Dizier
17 rue de la Victoire 
52100 Saint-Dizier
03 25 07 31 50
www.saint-dizier.fr

67 - Bas-Rhin

►Les 21 & 22 mars

"DÉFIS EN CASCADE !"
JOURNÉE MONDIALE DE L’EAU

Flotte ou coule, colle ou colore : explorez les propriétés physiques de l’eau à travers des défisludiques à réaliser en famille. Observez, testez, créez et laissez-vous surprendre en découvrant lesnotions de densité, pression, capillarité et pH. À partir de 3 ans.

Le Vaisseau
1 bis rue Philippe Dollinger 
67100 Strasbourg
03 69 33 26 69
www.levaisseau.com

►Jusqu’au 29 mars

EXPOSITION
"UN AMOUR DE LALIQUE – UNE IDÉE DE PARADIS"

Une sélection d’œuvres de la collection du Fonds Régional d’Art Contemporain (FRAC) Alsace entre en résonance avec un choix effectué parmi les pièces conservées au musée Lalique. Pour cette première collaboration, c’est une certaine vision du paradis qui est proposée au fil de l’exposition. 

Musée Lalique
40 rue du Hochberg
67290 Wingen-sur-Moder
03 88 89 08 14
www.musee-lalique.com

►Les 28 & 29 mars

LES SPECTACLES
"MINI CURIEUX"

La version Mini du Curieux Festival revient au Vaisseau ! Au programme : un week-end despectacles, de sciences et de merveilles pour faire germer la curiosité des enfants dès le plus jeuneâge. Tout publi. cRéservation et modalités sur lecurieuxfestival.com.

Le Vaisseau
1 bis rue Philippe Dollinger 
67100 Strasbourg
03 69 33 26 69
www.levaisseau.com

►Du 3 avril au 17 mai

EXPOSITION DES PHOTOGRAPHIES DE KARINE FABY
"MOSSI : UN VASE, DES SAVOIR-FAIRE"

Cette année, le choix a été fait de se concentrer sur les différentes étapes de fabrication d’un objet emblématique, le vase Mossi, dont le modèle a été créé par René Lalique en 1933. Depuis le travail sur le moule jusqu’à la signature finale, vous retrouverez toutes les étapes au travers de 20 photographies réalisées par Karine Faby.

Musée Lalique
40 rue du Hochberg
67290 Wingen-sur-Moder
03 88 89 08 14
www.musee-lalique.com

68 - Haut-Rhin

►Jusqu'au 28 juin

EXPOSITION 
"JOUSTRA, DES JOUETS MADE IN ALSACE"

Contraction de "JOUets de STRAsbourg", Joustra a produit de nombreux jouets avec un pic de popularité dans les années 1950 et 1960. Grâce à la collection d’un passionné bas-rhinois, Claude Schwach, venez découvrir tous types de jouets : jouets mécaniques, jouets téléguidés puis radiocommandés, voitures, grues, engins de chantier, bateaux, jeux scientifiques puis plus tard le célèbre télécran...

La Nef des Jouets
12 rue Jean Jaurès
68360 Soultz
03 89 74 30 92
www.ville-soultz.fr

75 - Paris

►Jusqu'au 10 janvier 2027

ZEUS, LE CHEVAL MÉTALLIQUE AU MUAM

Le musée accueille sur son parvis le cheval métallique Zeus, œuvre monumentale qui a marqué les esprits lors de la cérémonie d’ouverture des Jeux Olympiques et Paralympiques de Paris 2024.
Jusqu'au 29 mars 2026, dans le chœur de l’église Saint-Martin-des-Champs du MuAM, une exposition exceptionnelle intitulée "Zeus, chef-d’œuvre d’artisans" retrace la genèse et la fabrication de cette œuvre.

Musée des Arts et Métiers
60 rue Réaumur
75003 Paris
01 53 01 82 63
www.arts-et-metiers.net

►Jusqu'au 13 décembre

EXPOSITION
"CHAÏM KALISKI - JIM D’ETTERBEEK"

Double graphique de l’artiste, Jim d’Etterbeek est le titre d’une monumentale œuvre dessinée sur l’Occupation à Bruxelles, constituée de plus de cinq mille dessins de Chaïm-Charles Kaliski (1929-2015), être singulier dont l’existence fut à jamais marquée par la Shoah.

Musée d’art et d’histoire du Judaïsme
71 rue du Temple
75001 Paris
01 53 01 86 53
www.mahj.org

►Jusqu'au 17 mai 

EXPOSITION "FLOPS" 

Échec, bide, raté, fiasco… on estime que neuf innovations sur dix échouent et les raisons de la galère ne sont pas toujours évidentes ! En explorant les "bides" comme les trajectoires de réussites inattendues, l’exposition Flops-?! propose une lecture bienveillante de l’échec et ouvre la voie à une découverte singulière des collections du MuAM – Musée des Arts et Métiers.  

Musée des Arts et Métiers
60 rue Réaumur
75003 Paris
01 53 01 82 63
www.arts-et-metiers.net

►Jusqu'au 31 juillet 

EXPOSITION
"L’ÉTOFFE DES RÊVES"

Le vent de l’Art Brut et du surréalisme soufflera sur les 300 œuvres des 36 artistes réunis dans tout l’espace de la Halle Saint Pierre. "L’Étoffe des rêves" est le fruit d’une collaboration entre la Halle Saint Pierre et le Centre international du surréalisme et de la Citoyenneté mondiale à Saint-Cirq-Lapopie.

Halle Saint Pierre
2 rue Ronsard
75018 Paris
01 42 58 72 89
www.hallesaintpierre.org

84 - Vaucluse

►Le 28 mars

PROJECTION ET CONFÉRENCE
"MATISSE ET LYDIA"

Le Château de Lourmarin accueillera le 28 mars à 15h la projection du film « Matisse et Lydia », suivi d'un échange avec la réalisatrice Élisabeth Kapnist. Ce documentaire sensible retrace la relation entre Henri Matisse et Lydia Delectorskaya, muse et collaboratrice essentielle du peintre pendant plus de vingt ans.

Château de Lourmarin
2 avenue Laurent Vibert 
84160 Lourmarin 
04 90 68 15 23
www.chateaudelourmarin.com

Lieux:
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