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Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie
Actualités

Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie

Contrairement aux pandémies bien documentées comme celles de la peste noire, qui a persisté pendant près d'un demi-millénaire et qui a décimé la moitié de la population européenne, il n'y a pas de registres historiques permettant d'étudier l'impact causé par des bactéries responsables d'épidémies beaucoup plus circonscrites. Ainsi, on ne sait pas vraiment de combien de morts sont responsables des pathogènes tels qu'Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ou Staphylococcus aureus, bien qu'ils soient probablement liés à plusieurs millions de décès dans l'histoire.

Une bactérie commensale

Une des raisons expliquant cette anomalie tient au fait que la plupart de ces germes sont commensaux, c'est-à-dire qu'ils vivent en bonne intelligence avec leur hôte, dans ce cas l'humain. E.coli est, par exemple, présente dans l'intestin de tous les mammifères et de nombreux vertébrés, là aussi sans provoquer, la plupart du temps, de dégâts. Néanmoins, certaines souches de cette bactérie sont responsables d'intoxications alimentaires parfois sévères pouvant évoluer en septicémie ; elles affectent tout particulièrement les personnes les plus fragiles : vieillards, immunodéprimés ou jeunes enfants. L'actualité récente en a encore fait état avec le scandale des pizzas Buitoni. Une part de la gravité des infections à E.coli tient à la capacité de cette bactérie de résister aux traitements habituels, la fameuse "résistance aux antibiotiques". Comprendre comment cette ou plutôt ces résistances ont été acquises permettraient aux médecins de mieux cibler les traitements et donc soigner les malades. D'où l'intérêt de disposer de souches anciennes datant d'avant l'époque d'Alexander Fleming, le découvreur de la pénicilline.

Des nobles momifiés

C'est une telle souche, vieille de 400 ans, qui a été identifiée dans une momie italienne. Elle appartient à un groupe de nobles italiens dont les corps bien conservés ont été retrouvés à l'abbaye de Saint Domenico Maggiore, à Naples, en 1983. Pour l'étude, les chercheurs de l'Université McMaster, au Canada, et de l'Université Paris Cité ont effectué une analyse détaillée de l'un des individus, Giovani d'Avalos. Noble napolitain de la Renaissance, il avait 48 ans lorsqu'il mourut en 1586. L'individu souffrait d'une cholécystite chronique, une inflammation de la vésicule biliaire (dans le foie), provoquée par des calculs. Ces petits cailloux, qui provoquent de fortes douleurs, ont été analysés par Erick Denamur, spécialiste de la génétique des populations d’E.coli. Et le chercheur y a retrouvé des fragments de la bactérie, vieux de plus de 400 ans donc. "C’était tellement émouvant de typer cet ancien E. coli et de découvrir qu’il était presque unique mais qu’il s’inscrivait dans une lignée phylogénétique caractéristique des commensaux humains qui causent aujourd’hui des cholécystites", raconte-t-il dans un communiqué.

Des analyses et de la reconstruction du génome de cette bactérie ancestrale, il ressort que ses 4.446 gènes appartiennent au phylogroupe A et à une séquence exceptionnellement rare de type 4995. Elle ne possède pas de facteur de virulence spécifique ni de résistance acquise aux antibiotiques. En revanche, certains des gènes pouvant induire cette résistance sont déjà présents dans cette souche, indique l'étude publiée dans la revue Communications Biology. Le phylogroupe A est généralement présent dans l'intestin d'individus vivant dans des zones rurales ou des communautés peu urbanisées. Il est aussi fréquemment retrouvé dans les cas d'infections biliaires. Selon les chercheurs, il s'agit donc d'un germe opportuniste qui a affecté le foie de ce noble italien, profitant d'une circonstance immunitaire non élucidée.

Ce n'est pas la seule bactérie retrouvée : des fragments de Klebsiella aerogenes ont également été identifiés. Les deux germes auraient même échangé des gènes durant leur cohabitation dans les voies biliaires de Giovani d'Avalos. "Notre reconstruction de cet ancien E. coli aide à dépeindre une image plus complète du fardeau des infections opportunistes dans le passé", expliquent les chercheurs. Mais cette recherche permet aussi d'avoir un point de comparaison pour l'étude des évolutions des génomes des différentes souches d'E.coli et peut-être même de prédire leurs évolutions futures "en termes de virulence et de résistance et peut-être aussi celles d’autres pathogènes opportunistes", concluent les auteurs.


Source :  Joël Ignasse / Sciences et Avenir
Crédit :  Division de Paléopathologie de l'Université de Pise.

Une momie italienne du 16e siècle d'où a été extrait des fragments d'ADN d'E.coli.

Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie Actualités

Une ancienne souche d'Escherichia coli extraite d'une momie

Contrairement aux pandémies bien documentées comme celles de la peste noire, qui a persisté pendant près d'un demi-millénaire et qui a décimé la moitié de la population européenne, il n'y a pas de registres historiques permettant d'étudier l'impact causé par des bactéries responsables d'épidémies beaucoup plus circonscrites. Ainsi, on ne sait pas vraiment de combien de morts sont responsables des pathogènes tels qu'Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ou Staphylococcus aureus, bien qu'ils soient probablement liés à plusieurs millions de décès dans l'histoire.

Une bactérie commensale

Une des raisons expliquant cette anomalie tient au fait que la plupart de ces germes sont commensaux, c'est-à-dire qu'ils vivent en bonne intelligence avec leur hôte, dans ce cas l'humain. E.coli est, par exemple, présente dans l'intestin de tous les mammifères et de nombreux vertébrés, là aussi sans provoquer, la plupart du temps, de dégâts. Néanmoins, certaines souches de cette bactérie sont responsables d'intoxications alimentaires parfois sévères pouvant évoluer en septicémie ; elles affectent tout particulièrement les personnes les plus fragiles : vieillards, immunodéprimés ou jeunes enfants. L'actualité récente en a encore fait état avec le scandale des pizzas Buitoni. Une part de la gravité des infections à E.coli tient à la capacité de cette bactérie de résister aux traitements habituels, la fameuse "résistance aux antibiotiques". Comprendre comment cette ou plutôt ces résistances ont été acquises permettraient aux médecins de mieux cibler les traitements et donc soigner les malades. D'où l'intérêt de disposer de souches anciennes datant d'avant l'époque d'Alexander Fleming, le découvreur de la pénicilline.

Des nobles momifiés

C'est une telle souche, vieille de 400 ans, qui a été identifiée dans une momie italienne. Elle appartient à un groupe de nobles italiens dont les corps bien conservés ont été retrouvés à l'abbaye de Saint Domenico Maggiore, à Naples, en 1983. Pour l'étude, les chercheurs de l'Université McMaster, au Canada, et de l'Université Paris Cité ont effectué une analyse détaillée de l'un des individus, Giovani d'Avalos. Noble napolitain de la Renaissance, il avait 48 ans lorsqu'il mourut en 1586. L'individu souffrait d'une cholécystite chronique, une inflammation de la vésicule biliaire (dans le foie), provoquée par des calculs. Ces petits cailloux, qui provoquent de fortes douleurs, ont été analysés par Erick Denamur, spécialiste de la génétique des populations d’E.coli. Et le chercheur y a retrouvé des fragments de la bactérie, vieux de plus de 400 ans donc. "C’était tellement émouvant de typer cet ancien E. coli et de découvrir qu’il était presque unique mais qu’il s’inscrivait dans une lignée phylogénétique caractéristique des commensaux humains qui causent aujourd’hui des cholécystites", raconte-t-il dans un communiqué.

Des analyses et de la reconstruction du génome de cette bactérie ancestrale, il ressort que ses 4.446 gènes appartiennent au phylogroupe A et à une séquence exceptionnellement rare de type 4995. Elle ne possède pas de facteur de virulence spécifique ni de résistance acquise aux antibiotiques. En revanche, certains des gènes pouvant induire cette résistance sont déjà présents dans cette souche, indique l'étude publiée dans la revue Communications Biology. Le phylogroupe A est généralement présent dans l'intestin d'individus vivant dans des zones rurales ou des communautés peu urbanisées. Il est aussi fréquemment retrouvé dans les cas d'infections biliaires. Selon les chercheurs, il s'agit donc d'un germe opportuniste qui a affecté le foie de ce noble italien, profitant d'une circonstance immunitaire non élucidée.

Ce n'est pas la seule bactérie retrouvée : des fragments de Klebsiella aerogenes ont également été identifiés. Les deux germes auraient même échangé des gènes durant leur cohabitation dans les voies biliaires de Giovani d'Avalos. "Notre reconstruction de cet ancien E. coli aide à dépeindre une image plus complète du fardeau des infections opportunistes dans le passé", expliquent les chercheurs. Mais cette recherche permet aussi d'avoir un point de comparaison pour l'étude des évolutions des génomes des différentes souches d'E.coli et peut-être même de prédire leurs évolutions futures "en termes de virulence et de résistance et peut-être aussi celles d’autres pathogènes opportunistes", concluent les auteurs.


Source :  Joël Ignasse / Sciences et Avenir
Crédit :  Division de Paléopathologie de l'Université de Pise.

Une momie italienne du 16e siècle d'où a été extrait des fragments d'ADN d'E.coli.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .

17 - Charente Maritime

►A partir du 19 septembre

EXPOSITION
"PARURES ET MOTIFS DE LA PRÉHISTOIRE"

Fruit d’un projet mené avec deux classes de seconde en arts plastiques, l’exposition Archéofictions propose une relecture créative et sensible de la Préhistoire. Entre art et archéologie, Archéofictions invite à redécouvrir les parures et motifs de nos ancêtres, mêlant fiction, création contemporaine et savoir scientifique. 

Le Paléosite
Route de la Montée Verte 
17770 Saint-Césaire
05 46 97 90 90
https://paleosite.fr

2B - Haute-Corse

►Jusqu'au 20 décembre

EXPOSITION
"FEMIN’ISULA"

L’exposition retrace, de la préhistoire à nos jours, le rôle des femmes dans la société insulaire et leur marche vers l’émancipation voire les combats féministes. Le parcours riche de près de 300 oeuvres est argumenté et illustré par des portraits de femmes méconnues ou célèbres qui ont participé à l’évolution de la place des femmes dans la société insulaire.

Musée de Bastia
Place du donjon
La Citadelle
20200 Bastia
https://musee.bastia.corsica

33 - Gironde

►Jusqu'au 31 décembre

EXPOSITION GUSTAVE EIFFEL

Gustave Eiffel dont sa fameuse Tour et toutes ses réalisations de chantiers en France et dans le Monde, appuyé sur l’Exposiiton universelle  de 1889. A l’occasion de notre concours, nous avons reçu 107 œuvres de Tour Eiffel réalisées par les Amis du Musée qui sont exposées dans nos vitrines. Venez-vous plonger dans l’univers de Gustave Eiffel et sa vie trépidante.

Musée des Techniques
5 rue de Balambits
33640 Beautiran
05 57 97 75 11 / 06 07 74 03 76
http://villamaglya.fr

34 - Hérault

►Jusqu'au 1er mars

EXPOSITION
"IMMERSION URBAINE"

Exposition collective et évolutive réunissant plus de 18 artistes. Autour du thème de la récupération, du recyclage et de l’upcycling, chaque artiste construit à partir de cloisons de récupération et d’éléments de cinéma, pour créer un univers singulier. Présente à l’intérieur et aux extérieurs du musée, l'exposition offre aux visiteurs une expérience artistique renouvelée à chaque visite.

Musée Parcelle473
425 avenue frères Buhler
34080 Montpellier
06 66 02 69 29
www.parcelle473.com

38 - Isère

►Jusqu'au 30 mars 2026 

EXPOSITION
"PEINDRE LA LUMIÈRE, DE LA MAQUETTE AU VITRAIL"

Arcabas (1926-2018) s’est intéressé toute sa vie au vitrail qu’il abordait en tant que peintre avant tout. De l'expérience fondatrice de l'église Saint-Hugues aux dernières réalisations du Sacré-Cœur de Grenoble et de Saint-Christophe-sur-Guiers, l’exposition met l’accent sur les maquettes créées par Arcabas et la façon dont elles ont été traduites par les maitres verriers.

Musée arcabas en Chartreuse
Eglise de Saint-Hugues
38380 Saint-Pierre-de-Chartreuse
04 76 88 65 01
https://musees.isere.fr

41 - Loir-et-Cher

►Jusqu'au 4 janvier 2026

"NOËL ROYAL DANS LES CHÂTEAUX"

Chaque année les châteaux de Blois, Chambord, Cheverny et Chaumont-sur-Loire se mettent sur leur 31 pour vous émerveiller en décembre pendant les fêtes de Noël.
Chaque château son thème, ce qui en fait des visites singulières et inoubliables. Pour ne pas faire de choix, prenez le Pass Châteaux spécial Noël pour visiter 3 châteaux à 45 € ou 4 châteaux 61 €.

Office de tourisme Blois Chambord - Val de Loire
5 rue de la voûte 
41000 Blois
02 54 90 41 46
www.bloischambord.com

42 - Loire

►Le 6 décembre 

ATELIERS TEXTILES DE NOËL

Et si vous optiez pour des décorations textiles pour orner votre sapin de Noël ? Le musée vous propose pour la première fois des ateliers créatifs pour préparer les fêtes de fin d'année :
Pour les enfants : création d'un sapin en tissus - Pour les adultes : création d'une boule de Noël textile.
Samedi 6 décembre à 14h30. Réservation obligatoire. Tarif : 5 € par personne.

Musée du tissage et de la soierie
125 Place Vaucanson 
42510 Bussières
04 77 27 33 95
www.museedutissage.com

52 - Haute-Marne

►Jusqu'au 19 avril 2026

EXPOSITION 
"175 ANS DE CRÉATION BRASSICOLEÀ SAINT-DIZIER"

La brasserie du fort carré a été un des fleurons économiques de Saint-Dizier. En activité de 1796 à 1955, elle marqué le paysage urbain de la ville, et est à l’origine de la construction de la Tour Miko. Des techniques de productions de la bière, au nombreux objets publicitaires, l’exposition retracera l’histoire d’une brasserie restée dans les mémoires.

Musée de Saint-Dizier
17 rue de la Victoire 
52100 Saint-Dizier
03 25 07 31 50
www.saint-dizier.fr

63 - Puy de Dôme

►Jusqu''au 1er mars 2026

EXPOSITION 
"LE MOBILIER BIJOU" DE GUILLAUME PIÉCHAUD"

Découvrez l’importante rétrospective consacrée à cet artiste unique qui regroupe un ensemble inédit d’œuvres et d’objets personnels retraçant son riche parcours, des ateliers de bijouteries à la confection de mobilier monumental. De nombreuses animations pour les enfants en lien avec l'univers du designer Guillaume Piéchaud sont disponibles durant les vacances d'automne !

Musée Mandet
14 rue de l’Hôtel de Ville
63200 Riom
04 73 38 18 53
www.rlv.eu/decouvrir/musees/musee-mandet-1

67 - Bas-Rhin

►Jusqu'au 4 janvier 2026

EXPOSITION "HAPPY CRISTAL – DUEL DE NOËL !"
MUSÉE LALIQUE

Chaque année, Happy Cristal est un rendez-vous pour découvrir des mises en scène originales où les objets prennent vie. En 2025, les visiteurs pourront choisir entre deux propositions esthétiques très différentes. D’un côté, un Noël scandinave, blanc, lumineux et très lié à la nature. De l’autre côté, un Noël très coloré, inspiré des traditions nord-américaines. 

Musée Lalique
40 rue du Hochberg
67290 Wingen-sur-Moder
03 88 89 08 14
www.musee-lalique.com

68 - Haut-Rhin

►Jusqu'au 1er mars 2026

EXPOSITION
"STRUCTURES EN DÉRIVE"

La Fondation Fernet-Branca présente Structures en dérive, une exposition réunissant neuf artistes aux pratiques photographiques et transdisciplinaires.
L’exposition explore la photographie comme terrain d’expérimentation, entre approche documentaire et poétique.

Fondation Fernet-Branca
2 rue du Ballon
68300 Saint-Louis 
03 89 69 10 77
www.fondationfernet-branca.org

►Jusqu'au 31 décembre

EXPOSITION
"JOUSTRA"

Après les jouets Playmobil®, c'est une marque plus locale qui vient investir La Nef des Jouets : Joustra. Contraction de "JOUets de STRAsbourg", connaissant son pic de popularité dans les années 1950 et 1960 (jouets mécaniques, jouets téléguidés puis radiocommandés, voitures, grues, engins de chantier, bateaux, jeux scientifiques puis plus tard le célèbre télécran…).

La Nef des Jouets
12 rue Jean Jaurès
68360 Soultz
03 89 74 30 92
www.ville-soultz.fr

75 - Paris

►Jusqu'au 14 décembre 

EXPOSITION
"PAULA PADANI. LA DANSE MIGRANTE : HAMBOURG, TEL-AVIV, PARIS"

L’exposition retrace le parcours méconnu de la danseuse Paula Padani (1913-2001) à travers plus de 250 photographies, affiches, documents et costumes. Par sa vision du mouvement comme force de vie, par sa capacité de rebond entre plusieurs pays et cultures, elle aura frayé de nouvelles routes pour son art et joué un rôle pionnier dans l’émergence de la danse contemporaine israélienne. 

Musée d’art et d’histoire du Judaïsme
71 rue du Temple
75001 Paris
01 53 01 86 53
www.mahj.org

►Jusqu'au 4 janvier 2026

EXPOSITION 
"ÇA CHAUFFE CHEZ LES SCIENTIFIQUES" 

Les scientifiques sont les premiers, depuis des années, à nous alerter sur l’urgence climatique. Pourtant, la recherche est loin d’être écologique ou durable ! Comment concilier production de connaissances et responsabilité environnementale ? Et quel sens donner à cette mission dans un monde en pleine crise ? Pour y répondre, Julien Bobroff et l’équipe de "La Physique Autrement" vous présentent l'exposition "Ça chauffe les scientifiques".  

Musée des Arts et Métiers
60 rue Réaumur
75003 Paris
01 53 01 82 63
www.arts-et-metiers.net

►Du 17 décembre au 10 janvier 2027

ZEUS, LE CHEVAL MÉTALLIQUE AU MUAM !

Le musée accueille sur son parvis le cheval métallique Zeus, œuvre monumentale qui a marqué les esprits lors de la cérémonie d’ouverture des Jeux Olympiques et Paralympiques de Paris 2024.
Du 17 décembre 2025 au 29 mars 2026, dans le chœur de l’église Saint-Martin-des-Champs du MuAM, une exposition exceptionnelle intitulée "Zeus, chef-d’œuvre d’artisans" retrace la genèse et la fabrication de cette œuvre.

Musée des Arts et Métiers
60 rue Réaumur
75003 Paris
01 53 01 82 63
www.arts-et-metiers.net

►Jusqu'au 28 février 2026

EXPOSITION
"CLEMENCEAU ET LA GRÈCE"

Cette exposition met en lumière la relation profonde et inspirante que Georges Clemenceau a entretenue avec l’Hellade tout au long de sa vie. Cette passion, née de son éducation, a marqué sa carrière politique et sa vision du monde ainsi que son engagement pour la démocratie et la culture.

Musée Clemenceau
8 rue Benjamin Franklin
75116 Paris
01 45 20 53 41
https://musee-clemenceau.fr

►Jusqu'au 8 mars 2026

EXPOSITION
"DENISE BELLON. UN REGARD VAGABOND"

Le mahJ présente la première rétrospective à Paris, rassemblant près de 300 photographies, objets, lettres et publications, consacrée à Denise Bellon (1902-1999). Photographe humaniste, pionnière du photojournalisme et compagne de route des surréalistes, son œuvre singulière et méconnue court des années 1930 aux années 1970.

 Musée d’art et d’histoire du Judaïsme
71 rue du Temple
75001 Paris
01 53 01 86 53
www.mahj.org

►Jusqu'au 17 mai 2026

EXPOSITION "FLOPS" 

Échec, bide, raté, fiasco… on estime que neuf innovations sur dix échouent et les raisons de la galère ne sont pas toujours évidentes ! En explorant les "bides" comme les trajectoires de réussites inattendues, l’exposition Flops-?! propose une lecture bienveillante de l’échec et ouvre la voie à une découverte singulière des collections du MuAM – Musée des Arts et Métiers.  

Musée des Arts et Métiers
60 rue Réaumur
75003 Paris
01 53 01 82 63
www.arts-et-metiers.net

►Jusqu'au 31 juillet 2026

EXPOSITION
"L’ÉTOFFE DES RÊVES"

Le vent de l’Art Brut et du surréalisme soufflera sur les 300 œuvres des 36 artistes réunis dans tout l’espace de la Halle Saint Pierre. "L’Étoffe des rêves" est le fruit d’une collaboration entre la Halle Saint Pierre et le Centre international du surréalisme et de la Citoyenneté mondiale à Saint-Cirq-Lapopie.

Halle Saint Pierre
2 rue Ronsard
72018 Paris
01 42 58 72 89
www.hallesaintpierre.org

84 - Vaucluse

►Jusqu'en mars 2026

JEUX DE PISTE DE NOËL

Les jeunes visiteurs sont invités à parcourir le Château à travers un jeu de piste spécialement conçu pour les vacances de Noël, une aventure ludique et familiale.

Château de Lourmarin
2 avenue Laurent Vibert
84160 Lourmarin
04 90 68 15 23
www.chateaudelourmarin.com

►Jusqu'au 4 janvier 2026

EXPOSITION
"C'EST ICI"

L'exposition "C'est ici" réunit des oeuvres des XIXe et XXe siècles issues de collections particulières et du Musée Vouland et propose un parcours placé sous le signe du "local" et de la curiosité.

Musée Louis Vouland
17 rue Victor Hugo
84000 Avignon
04 90 86 03 79
www.vouland.com

►Jusqu'au 4 janvier 2026

EXPOSITION
"C'EST BRODÉ"

35 tableaux "à l'aiguille" sont exposés en contrepoint des tapisseries et des peintures présentées au musée. Réunis par Chantal et Dominique Dekester entre 1990 et 2010, ces objets sensibles, souvent anonymes, expriment dévotion ou amour. Ils témoignent d'un art d'agrément qui mêle broderie et peinture, de la place des travaux d’aiguille dans l’éducation des jeunes filles et des activités au sein des institutions religieuses. 

Musée Louis Vouland
17 rue Victor Hugo
84000 Avignon
04 90 86 03 79
www.vouland.com

►Jusqu'en mars 2026

EXPOSITION
"Les VOYAGES"

L'exposition Centenaire Robert Laurent-Vibert : Les Voyages donne un aperçu de l'héritage de Laurent-Vibert à travers sa collection privée sur le thème du voyage. 

Château de Lourmarin
2 avenue Laurent Vibert
84160 Lourmarin
04 90 68 15 23
www.chateaudelourmarin.com

87 - Haute-Vienne

►Jusqu'au 20 décembre

EXPOSITION
"OCEAN, LE PAPIER FAIT DES VAGUES"

Prenez une grande inspiration et plongez dans l'univers mystérieux des océans, à la découverte des œuvres incroyables d'une dizaine d'artistes papier. Une occasion idéale de s'émerveiller tout en se sensibilisant à la richesse et la fragilité de ces écosystèmes.

Le Moulin du Got
Le Pénitent
87400 St Léonard-de-Noblat
05 55 57 18 74
www.moulindugot.com

88 - Vosges

►Les 6 & 7 décembre

"PÉTANQUE DES PLANÈTES"
MAISON DU BAILLI

Venez pointer, tirer… et (re)découvrir les planètes de notre Système solaire à travers ce concept insolite pour petits grands ! Accessible à tous les âges, cette activité permet d’explorer notre Système solaire de manière concrète et joyeuse. Entre adresse, stratégie et découvertes scientifiques, chacun pourra s’y retrouver ! De 14h00 à 19h00. Entrée libre et gratuite.

Maison du Bailli
Place des Vosges
88000 Épinal

Lieux:
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