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Les "lions microbiens" : une nouvelle forme de vie sur Terre ?
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Les "lions microbiens" : une nouvelle forme de vie sur Terre ?

Les biologistes spécialistes du monde microscopique seraient-ils passés à côté d'une branche entière de l'arbre du vivant ? C'est ce que suggère une étude publiée par une équipe russo-canadienne dans la revue Nature.

Les auteurs décrivent deux nouveaux types de microbes jusqu'ici inconnus, les "nibbleridés" (de l'anglais 'nibble' qui signifie 'grignoter') et les "nébulidés", qui se nourrissent respectivement en grignotant des morceaux de leurs proies à l'aide de structures semblables à des dents, ou en les avalant toute entières.

D'après leurs travaux, ces organismes constituent, parmi les eucaryotes (domaine du vivant qui comprend notamment les plantes, les champignons et les animaux), un "super-groupe" à part, baptisé "Provora".

Les prédateurs, numériquement rares mais importants pour l'écosystème

A l'instar des lions, des guépards et d'autres prédateurs visibles à l'oeil nu, ces microbes sont numériquement rares mais importants pour l'écosystème, explique l'auteur principal de l'étude, Patrick Keeling, professeur au département de botanique de l'Université de la Colombie-Britannique (UBC) au Canada, dans un communiqué.

"Imaginez que vous soyez un extraterrestre et que vous preniez un échantillon du Serengeti (l'un des plus célèbres parcs nationaux en Tanzanie, NDLR) : vous obtiendriez beaucoup de plantes et peut-être une gazelle, mais aucun lion. Pourtant, les lions sont importants, bien que rares", illustre le chercheur, allant jusqu'à qualifier les Provora de "lions du monde microbien".

Ces "lions microbiens", l'équipe les a découvert en analysant des échantillons d'eau provenant d'habitats marins du monde entier, notamment les récifs coralliens de Curaçao (île des Caraïbes néerlandaises), des sédiments de la mer Noire et de la mer Rouge, ainsi que de l'eau des océans Pacifique Nord-Est et Arctique.

Cultiver les "lions microbiens" pour étudier leur ADN

"J'ai remarqué que certains échantillons d'eau contenaient de minuscules organismes dotés de deux flagelles, ou queues, qui tournaient convulsivement sur place ou nageaient très rapidement. C'est ainsi qu'a commencé ma chasse à ces microbes", témoigne le premier rédacteur de l'étude, le Dr Denis Tikhonenkov, chercheur à l'Académie des sciences de Russie, cité dans le communiqué.

Le scientifique russe a remarqué que dans les échantillons où ces microbes étaient présents, presque tous les autres organismes finissaient par disparaître au bout d'un ou deux jours. En fait, ces derniers étaient tout simplement mangés.

Le chercheur a donc fait l'expérience d'isoler les prédateurs et de les nourrir avec des protozoaires - des êtres unicellulaires déjà connus - afin de les cultiver dans le but d'extraire et d'étudier leur ADN. Un processus complexe, et ralenti à la fois par la guerre en Ukraine et par le Covid, qui ont empêché les scientifiques russes de se rendre chez leurs collègues canadiens, font-ils remarquer.

"Dans la taxonomie (science de la classification) des êtres vivants, nous utilisons souvent le gène 'ARNr 18S' pour décrire la différence génétique entre les organismes. Par exemple, les humains ne diffèrent des cochons d'Inde au niveau de ce gène que par six nucléotides (briques de base des séquences génétiques)", précise le Dr Tikhonenkov. "Nous avons été surpris de constater que sur ce critère, les microbes prédateurs diffèrent de 170 à 180 nucléotides par rapport à l'ensemble des autres êtres vivants sur Terre. Il est devenu évident que nous avions découvert quelque chose de complètement nouveau et d'étonnant."

Prochaine étape : séquencer intégralement leur génome

Au sein de la classification des êtres vivants selon leur lien de parenté, les "super-groupes" constituent l'échelon intermédiaire entre le domaine - eucaryotes, procaryotes et archées - et le règne (animal, végétal ou fongique par exemple). Entre cinq et sept super-groupes d'eucaryotes avaient été découverts jusqu'ici, dont le plus récent en 2018.

Or, il est crucial de mieux connaître ces branches potentiellement inconnues, afin de pouvoir comprendre les fondements du monde vivant et les mécanismes de l'évolution, soulignent les auteurs. "Ignorer les écosystèmes microbiens, comme nous le faisons souvent, c'est comme avoir une maison à réparer et se contenter de redécorer la cuisine, mais ignorer le toit ou les fondations", illustre le Dr Keeling.

Prochaine étape pour les scientifiques de l'équipe : séquencer intégralement les génomes des "lions microbiens", et modéliser les cellules en 3D afin d'en savoir plus sur leur organisation moléculaire, leur structure et leurs habitudes alimentaires, entrevoient-ils.


Source : Nastasia Michaels / GEO
Crédit : Nature  Информация взята с портала «Научная Россия» (https://scientificrussia.ru/)

Les provora, dont les images sont obtenues ici au microscope optique. La présence de deux flagelles est typique du supergroupe, ainsi que le sillon ventral  utilisé pour se nourrir. on voit également l'épine, une arme destructrice de microbe. les barres d'échelle font 3 μm.

Les "lions microbiens" : une nouvelle forme de vie sur Terre ? Actualités

Les "lions microbiens" : une nouvelle forme de vie sur Terre ?

Les biologistes spécialistes du monde microscopique seraient-ils passés à côté d'une branche entière de l'arbre du vivant ? C'est ce que suggère une étude publiée par une équipe russo-canadienne dans la revue Nature.

Les auteurs décrivent deux nouveaux types de microbes jusqu'ici inconnus, les "nibbleridés" (de l'anglais 'nibble' qui signifie 'grignoter') et les "nébulidés", qui se nourrissent respectivement en grignotant des morceaux de leurs proies à l'aide de structures semblables à des dents, ou en les avalant toute entières.

D'après leurs travaux, ces organismes constituent, parmi les eucaryotes (domaine du vivant qui comprend notamment les plantes, les champignons et les animaux), un "super-groupe" à part, baptisé "Provora".

Les prédateurs, numériquement rares mais importants pour l'écosystème

A l'instar des lions, des guépards et d'autres prédateurs visibles à l'oeil nu, ces microbes sont numériquement rares mais importants pour l'écosystème, explique l'auteur principal de l'étude, Patrick Keeling, professeur au département de botanique de l'Université de la Colombie-Britannique (UBC) au Canada, dans un communiqué.

"Imaginez que vous soyez un extraterrestre et que vous preniez un échantillon du Serengeti (l'un des plus célèbres parcs nationaux en Tanzanie, NDLR) : vous obtiendriez beaucoup de plantes et peut-être une gazelle, mais aucun lion. Pourtant, les lions sont importants, bien que rares", illustre le chercheur, allant jusqu'à qualifier les Provora de "lions du monde microbien".

Ces "lions microbiens", l'équipe les a découvert en analysant des échantillons d'eau provenant d'habitats marins du monde entier, notamment les récifs coralliens de Curaçao (île des Caraïbes néerlandaises), des sédiments de la mer Noire et de la mer Rouge, ainsi que de l'eau des océans Pacifique Nord-Est et Arctique.

Cultiver les "lions microbiens" pour étudier leur ADN

"J'ai remarqué que certains échantillons d'eau contenaient de minuscules organismes dotés de deux flagelles, ou queues, qui tournaient convulsivement sur place ou nageaient très rapidement. C'est ainsi qu'a commencé ma chasse à ces microbes", témoigne le premier rédacteur de l'étude, le Dr Denis Tikhonenkov, chercheur à l'Académie des sciences de Russie, cité dans le communiqué.

Le scientifique russe a remarqué que dans les échantillons où ces microbes étaient présents, presque tous les autres organismes finissaient par disparaître au bout d'un ou deux jours. En fait, ces derniers étaient tout simplement mangés.

Le chercheur a donc fait l'expérience d'isoler les prédateurs et de les nourrir avec des protozoaires - des êtres unicellulaires déjà connus - afin de les cultiver dans le but d'extraire et d'étudier leur ADN. Un processus complexe, et ralenti à la fois par la guerre en Ukraine et par le Covid, qui ont empêché les scientifiques russes de se rendre chez leurs collègues canadiens, font-ils remarquer.

"Dans la taxonomie (science de la classification) des êtres vivants, nous utilisons souvent le gène 'ARNr 18S' pour décrire la différence génétique entre les organismes. Par exemple, les humains ne diffèrent des cochons d'Inde au niveau de ce gène que par six nucléotides (briques de base des séquences génétiques)", précise le Dr Tikhonenkov. "Nous avons été surpris de constater que sur ce critère, les microbes prédateurs diffèrent de 170 à 180 nucléotides par rapport à l'ensemble des autres êtres vivants sur Terre. Il est devenu évident que nous avions découvert quelque chose de complètement nouveau et d'étonnant."

Prochaine étape : séquencer intégralement leur génome

Au sein de la classification des êtres vivants selon leur lien de parenté, les "super-groupes" constituent l'échelon intermédiaire entre le domaine - eucaryotes, procaryotes et archées - et le règne (animal, végétal ou fongique par exemple). Entre cinq et sept super-groupes d'eucaryotes avaient été découverts jusqu'ici, dont le plus récent en 2018.

Or, il est crucial de mieux connaître ces branches potentiellement inconnues, afin de pouvoir comprendre les fondements du monde vivant et les mécanismes de l'évolution, soulignent les auteurs. "Ignorer les écosystèmes microbiens, comme nous le faisons souvent, c'est comme avoir une maison à réparer et se contenter de redécorer la cuisine, mais ignorer le toit ou les fondations", illustre le Dr Keeling.

Prochaine étape pour les scientifiques de l'équipe : séquencer intégralement les génomes des "lions microbiens", et modéliser les cellules en 3D afin d'en savoir plus sur leur organisation moléculaire, leur structure et leurs habitudes alimentaires, entrevoient-ils.


Source : Nastasia Michaels / GEO
Crédit : Nature  Информация взята с портала «Научная Россия» (https://scientificrussia.ru/)

Les provora, dont les images sont obtenues ici au microscope optique. La présence de deux flagelles est typique du supergroupe, ainsi que le sillon ventral  utilisé pour se nourrir. on voit également l'épine, une arme destructrice de microbe. les barres d'échelle font 3 μm.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .


04 - Alpes de Haute-Provence

Jusqu'en avril 2023

EXPOSITION
"HABITER, HABITATS, HABITANTS"

Quels impacts les mutations urbaines du XXe siècle ont-elles eu sur les formes d’habiter dans un territoire marqué par la ruralité ? Etalement urbain, lotissements, éco-construction, chantiers et habitats participatifs… autant de thèmes qui sont abordés dans cette exposition qui donne la parole aux habitants.

Musée de Salagon
04300 Mane
04 92 75 70 50
www.musee-de-salagon.com


25 - Doubs

► Le 4 mars

"LA NUIT DE LA CHOUETTE"

Cette année encore, la LPO et la Saline royale organisent la Nuit de la chouette. Ateliers de découverte, observation sur le terrain et  pot de l’amitié à partager en famille ou entre amis.
De 18h à 21h30, sans réservation. Entrée gratuite.

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
03 81 54 45 13
www.salineroyale.com


► Du 5 mai au 5 novembre

EXPOSITION
"LE MONDE DE FOLON"

Hommage à Jean-Michel Folon (1934/2005), artiste belge à la création hybride et poétique représentant les grands maux de la société contemporaine. L’exposition à la Saline royale présentera plus de 200 œuvres issues de la Fondation Folon (affiches, dessins, sculptures…).

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
03 81 54 45 13
www.salineroyale.com


29 - Finistère

Jusqu'au 5 mars 2023

EXPOSITION
"VOYAGE EN TERRES AUSTRALES - CROZET & KERGUELEN 1772-2022"

Aujourd’hui, les archipels de Crozet et Kerguelen sont protégés par une réserve naturelle et élevés au rang de patrimoine mondial de l’UNESCO. Cet anniversaire est l’opportunité de raconter l’histoire de ces terres australes françaises à travers une exposition rassemblant objets et documents inédits.

Musée national de la Marine
Château de Brest
Rue du château 
29200 Brest
02 98 22 12 39
www.musee-marine.fr/brest


Les 6, 7 & 8 mai 2023

"LES JOURNÉES ROMAINES DE NÎMES, VERCINGÉTORIX

Grand spectacle historique. Plongez dans l’Histoire ! Dans les Arènes de Nîmes, 520 figurants venus de toute l’Europe vous font revivre l’histoire de Vercingétorix.
De Gergovie à Alesia, au plus près de la réalité historique, revivez les plus grandes batailles de la Guerre des Gaules qui opposa le légendaire chef gaulois au grand Jules César. Spectacles à 15h30.

Boulevard des Arènes
30000 Nîmes
04 66 21 82 56
www.arenes-nimes.com


34 - Hérault

Jusqu'au 19 mars 2023

EXPOSITION
"PAYSAGES DE COROT À SIMA"

Découvrez près de deux siècles d’art, deux siècles de perception de la nature, et deux siècles de vues à couper le souffle.
Des côtes de Normandie aux forêts du sud de la France, des terres alsaciennes aux pins des landes, découvrez notre pays à travers le regard des plus grands artistes des siècles derniers.

Musée de Lodève
Square George Auric
34700 Lodève
04 67 88 86 10
www.museedelodeve.fr


35 - Ille et Vilaine

► Jusqu'au 3 septembre 2023

EXPOSITION
"RACES BRETONNES : UNE HISTOIRE BIEN VIVANTE"

Vache Bretonne pie noir, mouton d'Ouessant et autres poule Coucou de Rennes s'invitent dans la salle d'exposition de l'Écomusée de la Bintinais !
Des œuvres d'art, des collections techniques et ethnographiques ainsi qu'une riche iconographie accompagnent cette plongée à la découverte des races bretonnes, emblèmes d'une histoire et d'un patrimoine bien vivants !

Écomusée de la Bintinais
Route de Châtillon-Sur-Seiche
35200 Rennes
02 99 51 38 15
www.ecomusee-rennes-metropole.fr


39 - Jura

► Du 4 février au 4 mars 

EXPOSITION
"ARTISANS, PASSEURS DE SAVOIR-FAIRE"

L'exposition vous emmène à la découverte des techniques, des défis et du parcours de 18 artisans formateurs, membres du réseau de l’Atelier des savoir-faire. 
Ainsi, les métiers de muretier, peintre sur soie, tailleur de pierre, sculpteur sur bois, céramiste... seront présenté à travers le regard de chaque artisan.
L’Atelier des savoir-faire propose pour chaque maîtrise exposée, des stages de formation tout au long de l’année.

L’Atelier des savoir-faire
1 Grand’Rue
39170 Ravilloles
03 84 42 65 06
www.atelierdessavoirfaire.fr


Jusqu'au 5 novembre 2023

EXPOSITION
"L'OURS DANS LA BIODIVERSITÉ POLAIRE"

Embarquez dans un voyage naturaliste au milieu des glaces, sur la piste de l’ours. A travers cette exposition, c’est la biodiversité polaire qui est mise à l’honneur.

Espace des Mondes Polaires
46 rue Croix de la Teppe 
39220 Prémanon
03 39 50 80 20
www.espacedesmondespolaires.org


► Du 4 février au 25 mars 2023

EXPOSITION
"BRUITS DE GLACE"

L'exposition "Bruits de glace" est un assemblage d'impressions, de textes et de dessins qui vous fera voyager dans les fjords de Groenland Est, lieux sillonnés en voiliers par Sarah Bovet en 2019.

Espace des Mondes Polaires
46 rue Croix de la Teppe 
39220 Prémanon
03 39 50 80 20
www.espacedesmondespolaires.org


73 - Savoie

Du 6 au 17 février 

ATELIERS
"L'EAU ET LES ANIMAUX LACUSTRES"

Pour ces vacances d'hiver Aqualis propose, à travers des ateliers où l'expérience scientifique parlera avec la création artistique, un programme autour de 2 grands thèmes : l'eau et la biodiversité.

Aqualis
52 esplanade Jean Murguet
73100 Aix-les-Bains
04 79 70 64 69
aqualis-lacdubourget.fr


62 - Pas-de-Calais

► Du 4 au 19 février

EXPOSITION 
"HÉRITAGE DES TEMPLIERS"

Le musée Bruno-Danvin de Saint Pol sur Ternoise offre son espace d’exposition à Daciana Pszota. L’artiste participe à diverses expositions collectives en Italie et en Roumanie.
Inspirée par l'histoire et la spiritualité, ses émotions personnelles s'expriment aussi dans ses œuvres.

Musée municipal Bruno Danvin
Rue Oscar Ricque
62130 Saint-Pol-sur-Ternoise
03 21 04 56 25 / 07 89 08 15 64 
www.saintpolsurternoise.fr


74 - Haute-Savoie

► A partir du 4 février

ACRO'AVENTURES REIGNIER
UN SITE MULTI-ACTIVITÉS ACCESSIBLE À TOUS

Le parcours de Reignier ouvrira du 4 au 19 février tous les jours, puis restera ouvert les mercredis et week-end jusqu'au samedi 1er avril (début de la grande saison).

Acro'Aventures Reignier
Route des Rocailles
74930 Reignier
06 43 16 27 59
www.reignier.acro-aventures.com


75 - Paris

Jusqu'au 25 février 2023

EXPOSITION
"CLEMENCEAU ET LES PHOTOGRAPHES DE L’INTIME"

Le parcours de l’exposition-focus suit les premiers pas de Clemenceau devant l’objectif de son père et, plus tard, en politique, sous l’œil de son ami Félix Nadar rencontré durant la Commune.
L’exposition- se clôture par des photographies de famille immortalisant les moments de bonheur et de complicité avec ses enfants et petits-enfants.

Musée Clemenceau
8 rue Benjamin Franklin,
75116 Paris
01 45 20 53 41
https://musee-clemenceau.fr


77 - Seine et Marne

Du 4 février au 5 mars

PARROT WORLD
"CARNAVAL DE RIO"

Finis les congés d'hiver pour le parc! Une nouvelle saison débute à Parrot World le samedi 4 février 2023 sur le thème du Carnaval de Rio avec plein d' animations. Au programme : ateliers maquillage, masques, coloriages, parade musicale...

Parrot World
Route de Guérard
77580 Crécy-la-Chapelle
01 86 70 06 84
www.parrotworld.fr

Lieux:

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