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Un « arbre de la vie » interactif
Actualités

Un « arbre de la vie » interactif

À la manière d’un arbre généalogique, l’histoire de l’évolution peut être représentée sous la forme d’un « arbre de la vie », chaque feuille représentant une espèce et chaque nœud un ancêtre. Afin d’en montrer l’ensemble des niveaux hiérarchiques et relations entre espèces, Damien de Vienne, chercheur au Laboratoire de biométrie et biologie évolutive à l’université Claude Bernard Lyon-1, a réalisé un outil interactif permettant de parcourir tout l’arbre de la vie. « Ma femme est cartographe et je suis donc intéressé par cette manière de représenter les choses, explique-t-il. Or il manquait aux chercheurs un outil équivalent à Google Maps pour la cartographie traditionnelle, permettant de visualiser les ramifications d’un arbre ». Un outil très utile à ce chercheur qui se consacre notamment à la génomique comparative : « Je me demande parfois s’il existe des espèces proches de celles dont je détiens le génomes. Lifemap permet de se promener dans l'arbre de la vie et de retrouver facilement les liens de parenté ». Il a présenté son travail dans un article paru le 22 décembre 2016 dans la revue PLoS Biology.

Les données sur les millions d’espèces qui composent « l'arbre de la vie » sont disponibles sur deux sites : d’une part, la base de données de taxonomie du NCBI, le Centre américain pour l’information biotechnologique ; d’autre part, le site du consortium Open Tree of Life. Elles ont permis de réaliser les trois versions accessibles en ligne, chacune présentant un nombre différent d’espèces : 800 000 pour le grand public, avec un arbre un peu simplifié ; 2,2 millions pour la version tirée du site Open Tree of Life et 1,4 million d’espèces pour la version NCBI. La première version contient aussi des éléments pédagogiques (photos, textes) à chaque « nœud » de l'arbre.  

Outre l'intérêt immédiat pour les chercheurs et les internautes curieux, cet arbre fait appel à un programme informatique en open source, susceptible d’être repris pour visualiser d’autres informations comme la généalogie des rois de France.


Source : Universcience
Crédit : Damien de Vienne/CNRS

Les trois grandes branches de l'arbre de vie : les archées, les bactéries et les eucaryotes (organismes se caractérisant par la présence d'un noyau).

Un « arbre de la vie » interactif Actualités

Un « arbre de la vie » interactif

À la manière d’un arbre généalogique, l’histoire de l’évolution peut être représentée sous la forme d’un « arbre de la vie », chaque feuille représentant une espèce et chaque nœud un ancêtre. Afin d’en montrer l’ensemble des niveaux hiérarchiques et relations entre espèces, Damien de Vienne, chercheur au Laboratoire de biométrie et biologie évolutive à l’université Claude Bernard Lyon-1, a réalisé un outil interactif permettant de parcourir tout l’arbre de la vie. « Ma femme est cartographe et je suis donc intéressé par cette manière de représenter les choses, explique-t-il. Or il manquait aux chercheurs un outil équivalent à Google Maps pour la cartographie traditionnelle, permettant de visualiser les ramifications d’un arbre ». Un outil très utile à ce chercheur qui se consacre notamment à la génomique comparative : « Je me demande parfois s’il existe des espèces proches de celles dont je détiens le génomes. Lifemap permet de se promener dans l'arbre de la vie et de retrouver facilement les liens de parenté ». Il a présenté son travail dans un article paru le 22 décembre 2016 dans la revue PLoS Biology.

Les données sur les millions d’espèces qui composent « l'arbre de la vie » sont disponibles sur deux sites : d’une part, la base de données de taxonomie du NCBI, le Centre américain pour l’information biotechnologique ; d’autre part, le site du consortium Open Tree of Life. Elles ont permis de réaliser les trois versions accessibles en ligne, chacune présentant un nombre différent d’espèces : 800 000 pour le grand public, avec un arbre un peu simplifié ; 2,2 millions pour la version tirée du site Open Tree of Life et 1,4 million d’espèces pour la version NCBI. La première version contient aussi des éléments pédagogiques (photos, textes) à chaque « nœud » de l'arbre.  

Outre l'intérêt immédiat pour les chercheurs et les internautes curieux, cet arbre fait appel à un programme informatique en open source, susceptible d’être repris pour visualiser d’autres informations comme la généalogie des rois de France.


Source : Universcience
Crédit : Damien de Vienne/CNRS

Les trois grandes branches de l'arbre de vie : les archées, les bactéries et les eucaryotes (organismes se caractérisant par la présence d'un noyau).

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .


22 - Côtes d'Armor

Du 22 janvier au 12 mars

ATELIERS PEINTURE

"Aquarelle" avec Fanny Dreveau - Samedis 22 Janvier et 19 février de 10h à 16h30h
"Peinture à l'huile et clair-obscur" avec Jos Van de Ven - Vendredis 28 Janvier et 4 Mars de 10h à 16h30
"Calligraphie chinoise et abstraction" avec Sophie Deliss - Samedis 5 Février et 12 Mars de 10h à 16h30
"ARTIS" Arts Plastiques avec Claire Amossé - Samedis 12 Février et 5 Mars de 10h à 16H30

Pôle de l'Étang-Neuf
Musée de la Résistance en Argoat
22480 Saint-Connan
02 96 47 17 66
www.etangneufbretagne.com


34 - Hérault

Jusqu'au 27 mars 2022

EXPOSITION
"JEAN-FRANCIS AUBURTIN, UN ÂGE D'OR"

Jean-Francis Auburtin (1866-1930) s’inscrit dans la longue procession des peintres sur le motif : Delacroix, Courbet, Boudin, Jongkind, Monet...
En une centaine d'œuvres, le Musée de Lodève propose une rétrospective de ce peintre à redécouvrir.

Musée de Lodève
Square George Auric
34700 Lodève
04 67 88 86 10
www.museedelodeve.fr


39 - Jura

Jusqu'au 15 mars

EXPOSITION
"FRONTIÈRES DE SEL"

Reproductions d’objets, contenus numériques, vidéos et extraits sonores, archives inédites vous dévoileront tous les secrets du commerce du sel.
Une part belle sera également faite aux métiers de la restauration et du patrimoine avec la présentation en timelapse du travail de l’atelier Lythos, qui a réalisé un fac-similé de la borne destiné à être replacé sur le lieu de découverte à Montigny-les-Arsures.

La Grande Saline
3 place des salines
39110 Salins-les-Bains
03 84 73 10 92
www.salinesdesalins.com


71 - Saône et Loire

Le 16 février

ATELIERS
"BRICO RECUP"

Réutiliser, récupérer, créer, s’amuser… Voilà le programme de notre atelier récup’ où nous transformerons rouleaux de papier toilette, boîtes à œufs et bouteilles plastique en petits animaux et autres petits bricolages rigolos à emporter à la maison. A partir de 6 ans. De 14 h à 16 h .

Centre EDEN
26 rue de l’Eglise
71290 Cuisery
03 85 27 08 00
www.centre-eden71.fr


Le 23 février

ATELIERS
"NICHOIRS ET CIE"

Présentation de nichoirs, conseil sur leur fabrication et leur installation. Assemblage d’un modèle en salle (choix à faire parmi 3 références). Tout public, enfants à partir de 9 ans. Dd 14 h à 16 h 30.

Centre EDEN
26 rue de l’Eglise
71290 Cuisery
03 85 27 08 00
www.centre-eden71.fr


88 - Vosges

Du 5 février au 18 septembre  

EXPOSITION
"POSADA, GENIE DE LA GRAVURE"

Cette exposition, première rétrospective en France de l’œuvre de José Guadalupe Posada (1852-1913) nous permet d’admirer l’inventivité et la dextérité d’un des grands maîtres de la gravure internationale qui a délaissé une carrière toute tracée pour mettre son talent au service de la presse populaire : illustrations de faits divers, contes, chansons... et les fameuses Calaveras.

Musée de l'Image
42 quai de Dogneville
88000 Épinal
03 29 81 48 30
https://museedelimage.fr

Lieux:

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