Bienvenue dans un nouveau monde... le notre

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol
Actualités

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol Actualités

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .

07 - Adèche

Du 1er mai au 15 novembre
Exposition "ENTRE TERRE ET EAU"

Crises sociales et environnementales dans le Delta du Danube en Roumanie, à la fin du Néolithique. A près de 2 000 km de l'Ardèche, comment se passe la fin de la Préhistoire au bord du fleuve et de la Mer Noire ? Une exposition franco-roumaine inédite, interactive et immersive, à découvrir à la Cité de la Préhistoire !

Grand Site de l’Aven d’Orgnac
Place Robert de Joly
07150 Orgnac–L’Aven
04 75 38 65 10
www.orgnac.com


Du 20 octobre au 4 novembre
Démonstration "LES SECRETS DU FEU"

Un animateur de la Cité de la Préhistoire vous dévoile les différentes techniques d’allumage du feu à la manière préhistorique, bien avant l’invention du briquet : en frottant des cailloux ou du bois, tout simplement !
Durée : 30 min. De 11h45, 14h et 16h45.

Grand Site de l’Aven d’Orgnac
Place Robert de Joly
07150 Orgnac–L’Aven
04 75 38 65 10
www.orgnac.com


Du 20 octobre au 4 novembre
Visite spéciale Famille "LE COFFRE MYSTÉRIEUX"

Venez explorer la préhistoire autrement en partant à la recherche d’un mystérieux objet préhistorique dans la Cité. Un voyage dans le Temps pour petits et grands, qui devront revêtir les habits et ustensiles de nos
ancêtres pour traverser les âges anciens. Accompagnés par un archéologue et sa machine à remonter le Temps, saurez vous résoudre l’énigme ?
Durée : 1h15. A partir de 5 ans.

Grand Site de l’Aven d’Orgnac
Place Robert de Joly
07150 Orgnac–L’Aven
04 75 38 65 10
www.orgnac.com


14 - Calvados

Jusqu’au 29 février 2020
Exposition
"LES REQUINS ! 430 MILLIONS D’ANNÉES D’ÉVOLUTION"

Découvrez la grande diversité des requins, allant d’espèces de petites tailles, jusqu’aux poissons géants dont les dents sont plus grandes qu’une main humaine.
Cette exposition évoque également le grand danger auquel ils sont confrontés : l’Homme. Venez découvrir de nouvelles espèces et apprendre en vous amusant grâce à une fresque digitale.

Paléospace
Avenue Jean Moulin
14640 Villers-sur-Mer
02 31 81 77 60
www.paleospace-villers.fr


21 - Côte d'Or

Jusqu’au 6 janvier 2019
Exposition "GRAINES"

Elles sont partout… Du petit-déjeuner au coucher, dans nos vêtements, dans notre alimentation, dans nos parcs et jardins… sans même y penser elles font partie de notre quotidien et sont un pilier de la biodiversité végétale.
Cette nouvelle exposition, très ludique, propose à tous les visiteurs de découvrir une grande variété de graines d’ici et d’ailleurs et de s’interroger sur leurs enjeux dans un contexte de changement climatique et sociétal.

Le Jardin des sciences
Parc de l’Arquebuse
21000 Dijon
03 80 48 82 00
www.dijon.fr


Jusqu’au 31 mars 2019

Exposition de plein air
"IMPACTS ! HOMME-NATURE"

Venez découvrir les relations homme-nature au plus près du vivant !
De l’évolution du comportement animal à celui du climat et des milieux naturels, les chercheurs de Bourgogne et de Franche-Comté tentent de comprendre le rôle de l’Homme dans ces changements. Traversez ville, campagne et forêt et voyagez jusqu’aux pôles pour observer ces recherches in vivo !

Le Jardin des sciences
Parc de l’Arquebuse
21000 Dijon
03 80 48 82 00
www.dijon.fr


41 - Loir et Cher

Jusqu'au 31 décembre
LES JARDINS DE CHAMBORD

Le château a retrouvé en 2017 ses jardins à la française du XVIIIe siècle avec six hectares et demi au pied de la façade nord du château : plus de 600 arbres, 800 arbustes, 200 rosiers, 15 250 plantes...

Office de Tourisme de Blois-Chambord
23 place du château
41000 Blois
02 54 90 41 41
http://www.bloischambord.com


49 - Maine et Loire

Du 20 octobre au 4 novembre
"CONTES ET RACONTÉES SPÉCIAL 3-9 ANS"

Les raconte-tapis débarquent au Bioparc pour plonger les enfants dans l’univers des contes animaliers ! Réunis autour de ces magnifiques créations tissées mains animées par nos soigneurs, les enfants découvrent le terrain d’aventure des personnages de l’histoire.

Bioparc Doué la Fontaine
103 rue de Cholet
49700 Doué-en-Anjou
02 41 59 18 58
www.bioparc-zoo.fr


61 - Orne

Du 13 octobre au 23 décembre
Exposition : "LES HAIES", Joël Auxenfans

Ecomusée du Perche
Prieuré de Sainte-Gauburge
61130 Saint-Cyr-la-Rosiere
02 33 73 48 06
www.ecomuseeduperche.fr


76 - Seine Maritime

Du 15 septembre au 15 décembre
Exposition "L’abbé Pierre photographe, un regard sur le monde"

L'exposition présente soixante-dix photographies inédites prises par l’abbé Pierre lui-même dans de nombreux pays. Elles témoignent de la vitalité des personnes pauvres dans le monde et dévoilent le regard lucide et plein d’amour.

Centre abbé Pierre - Emmaüs
Route d'Emmaüs
76690 Esteville
02 35 23 87 76
www.centre-abbe-pierre-emmaus.org


87 - Haute-Vienne

Du 1er avril au 4 novembre
Exposition : « L’ÉLOGE DE L’ÉTRANGE ET DE L’INCOMPRIS »

Une revisite du Cabinet des Curiosités par 7 artistes qui explorent des thèmes à la fois scientifiques et naturalistes, mais aussi oniriques et bouleversants, merveilleux et revendiquant.

La Cité des insectes
Chaud 87120 Nedde
05 55 04 02 55
www.lacitedesinsectes.com


31 octobre
LA CHASSE D’HALLOWEEN AUX PETITES BÊTES !

La Chasse d’Halloween aux petites bêtes ! Avec dégustation d’insectes ! des cadeaux pour tout le monde mais surtout la famille la mieux déguisée recevra une belle surprise.

La Cité des insectes
Chaud 87120 Nedde
05 55 04 02 55
www.lacitedesinsectes.com

Lieux:

Découvrir toutes les activités