Bienvenue dans un nouveau monde... le notre

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol
Actualités

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol Actualités

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .

03 - Allier

Du 1er juin au 30 septembre
Exposition "L'ARTISANAT AU FIL DU TEMPS"

Maison de la Combraille
Place Pierre Bitard
03420 Marcillat-en-Combraille
04 70 51 10 23
maisondelacombraille.over-blog.com


Du 3 au 22 juillet
Exposition :  "LA BARBE A TRAVERS LES TEMPS"

Les rasophiles d'Oc et Oïl. Collection de rasoirs et objets s'y rapprochant au fil de l'histoire.

Maison de la Combraille
Place Pierre Bitard
03420 Marcillat-en-Combraille
04 70 51 10 23
maisondelacombraille.over-blog.com


25 juillet
Découverte nature
HAUTE VALLE DE CHER, TERRE DE CONFINS

Histoire et lecture de paysages, faune et flore. Encadrée par Renée Couppat (Chemin de Travers).

Maison de la Combraille
Place Pierre Bitard
03420 Marcillat-en-Combraille
04 70 51 10 23
maisondelacombraille.over-blog.com


04 - Alpes de Haute-Provence

Du 3 au 7 août
CORSO DE LA LAVANDE

Au pays des champs de lavande, très joli Corso de fleurs avec des parades de jour et de nuit, animations musicales, marché artisanale, feu d’artifice.

Comité des fêtes
1 boulevard Martin Bret
04000 Digne-les-Bains
06 34 41 86 29
www.cdf-dignelesbains.fr


05 - Hautes Alpes

Du 30 juin au 6 juillet
CHAMPIONNAT DE PARAPENTE OZONE

Compétition amicale de parapente entre les différents pilotes mondiaux et expérimentés, avec des vols dans une zone magnifique au départ de la montagne de Chabre dans la Vallée de la Méouge !

Montagne de Chabre
Châteauneuf de Chabre
05300 Val Buëch-Méouge
04 92 65 09 38


07 - Adèche

Du 1er mai au 15 novembre
Exposition "ENTRE TERRE ET EAU"

Crises sociales et environnementales dans le Delta du Danube en Roumanie, à la fin du Néolithique. A près de 2 000 km de l'Ardèche, comment se passe la fin de la Préhistoire au bord du fleuve et de la Mer Noire ? Une exposition franco-roumaine inédite, interactive et immersive, à découvrir à la Cité de la Préhistoire !

Grand Site de l’Aven d’Orgnac
Place Robert de Joly
07150 Orgnac–L’Aven
04 75 38 65 10
www.orgnac.com


14 - Calvados

24 juin
Visite guidée "ODYSSÉE JURASSIQUE"

Partez à la découverte du monde jurassique à travers les fossiles trouvés à Villers-sur-Mer avec l’un des médiateurs scientifiques du musée. Une visite ludique et pleine de découvertes pour petits et grands. Durée : 1h00.

Paléospace
Avenue Jean Moulin
14640 Villers-sur-Mer
02 31 81 77 60
www.paleospace-villers.fr


Jusqu’au 29 février 2020
Exposition
"LES REQUINS ! 430 MILLIONS D’ANNÉES D’ÉVOLUTION"

Découvrez la grande diversité des requins, allant d’espèces de petites tailles, jusqu’aux poissons géants dont les dents sont plus grandes qu’une main humaine.
Cette exposition évoque également le grand danger auquel ils sont confrontés : l’Homme. Venez découvrir de nouvelles espèces et apprendre en vous amusant grâce à une fresque digitale.

Paléospace
Avenue Jean Moulin
14640 Villers-sur-Mer
02 31 81 77 60
www.paleospace-villers.fr


21 - Côte d'Or

Jusqu’au 6 janvier 2019
Exposition "GRAINES"

Elles sont partout… Du petit-déjeuner au coucher, dans nos vêtements, dans notre alimentation, dans nos parcs et jardins… sans même y penser elles font partie de notre quotidien et sont un pilier de la biodiversité végétale.
Cette nouvelle exposition, très ludique, propose à tous les visiteurs de découvrir une grande variété de graines d’ici et d’ailleurs et de s’interroger sur leurs enjeux dans un contexte de changement climatique et sociétal.

Le Jardin des sciences
Parc de l’Arquebuse
21000 Dijon
03 80 48 82 00
www.dijon.fr


Du 27 mai au 3 septembre
Exposition de plein-air
"AMIS POLLINISATEURS, BIENVENUE EN VILLE !"

En ville vivent des centaines d'espèces d'insectes, dont beaucoup jouent un rôle très utile pour les humains : en butinant de fleurs en fleurs à la recherche de nourriture, ils transportent le pollen, assurant ainsi la reproduction d'un grand nombre de plantes. Ce sont des pollinisateurs !

Le Jardin des sciences
Parc de l’Arquebuse
21000 Dijon
03 80 48 82 00
www.dijon.fr


30 - Gard

Du 5 mai au 30 septembre
"O3" Rétrospective de 25 ans de l'art du cube

Nicolas GAL, peintre plasticien présentera une Dériode de création en cube, des oeuvres de jeunesse où est figurée avec les mythes méditerranéens, jusqu'à des oeuvres plus récentes dénonçant l'exil moderne lié à l'eau.

La Maison de l'eau
30122 Les Plantiers
04 66 30 36 55 / 04 66 25 83 41
www.caussesaigoualcevennes.fr


50 - MANCHE

Du 5 février au 31 août
Exposition "SCIENCES EXTRAORDINAIRES"

"Des récits de Jules Verne aux mondes de demain". Une exposition entièrement consacrée à l’auteur et sa vision de l’univers futuriste.

Planétarium Ludiver
1700 rue de la Libération
Tonneville - 50460 La Hague
02 33 78 13 80
www.ludiver.com


18 et 19 juillet
FESTIVAL DE FUSÉES À EAU

Venez fabriquez la plus belle fusée et surtout la plus rapide !
•Ateliers de construction de fusées à eau en continu pour toute la famille
•Décollages de vos fusées dans le parc paysager

Planétarium Ludiver
1700 rue de la Libération
Tonneville - 50460 La Hague
02 33 78 13 80
www.ludiver.com


3 août
NUIT DES ÉTOILES

A l’occasion de cette soirée exceptionnelle, les visiteurs découvriront gratuitement les mystères de la voûte céleste dès 20h et tout au long de la soirée. De nombreuses animations adaptées à chaque public, ponctueront cette soirée. Des ateliers spécialement adaptés au jeune public et aux familles seront proposés.

Planétarium Ludiver
1700 rue de la Libération
Tonneville - 50460 La Hague
02 33 78 13 80
www.ludiver.com


61 - Orne

Du 14 juillet au 16 septembre

Expositions
"COMPLICITÉS, IMAGES D'UN VÉTÉRINAIRE DE CAMPAGNE"
"VAISSELLE DE GUERRE, OU DU FRICHTI À L’ASSIETTE COMMÉMORATIVE"

Ecomusée du Perche
Prieuré de Sainte-Gauburge
61130 Saint-Cyr-la-Rosiere
02 33 73 48 06
www.ecomuseeduperche.fr


Du 13 octobre au 23 décembre
Exposition : "LES HAIES", Joël Auxenfans

Ecomusée du Perche
Prieuré de Sainte-Gauburge
61130 Saint-Cyr-la-Rosiere
02 33 73 48 06
www.ecomuseeduperche.fr


65 - Hautes-Pyrénées

21 juillet
Visite : "LES ANIMAUX DE GARGAS"

Une fois n’est pas coutume, ce sont les animaux qui seront à l’honneur pendant cette soirée. Ils sont gravés ou peints sur les parois, ils ont été mangé par les gravettiens, ils ont vécu ou vivent encore dans la grotte…
1h30 de visite – Limité à 24 personnes. Rdv 21h15.

Grottes de Gargas / Nestplori@
Rd 261
65660 Aventignan
05 62 98 81 50
www.grottesdegargas.fr


4 août
GRAVER, PEINDRE DANS UNE GROTTE : UNE EXPÉDITION SOUTERRAINE

Aller au fond d’une grotte pour peindre ou graver n’est pas une chose anodine ! Évoluer sur un sol accidenté, marcher, ramper ou encore escalader des parois dans l’obscurité et l’humidité montre que nos ancêtres prenaient des risques insensés ! 1h00 de visite – Démonstration d’allumage de feu selon la technique de la percussion, 30 min – Limité à 24 personnes.

Grottes de Gargas / Nestplori@
Rd 261
65660 Aventignan
05 62 98 81 50
www.grottesdegargas.fr


70 - Haute-Saône

► Du 3 avril au 30 septembre
EXPOSITION "MARTIN LUTHER KING"

Cette exposition retrace la vie et les combats menés par Martin Luther King.

Maison de la Négritude et des Droits de l'Homme
25 Grande Rue
70290 Champagney
03 84 23 25 45
http://www.maisondelanegritude.fr

Lieux:

Découvrir toutes les activités