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Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol
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Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol Actualités

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .


04 - Alpes de Haute-Provence

Jusqu'en avril 2023

EXPOSITION
"HABITER, HABITATS, HABITANTS"

Quels impacts les mutations urbaines du XXe siècle ont-elles eu sur les formes d’habiter dans un territoire marqué par la ruralité ? Etalement urbain, lotissements, éco-construction, chantiers et habitats participatifs… autant de thèmes qui sont abordés dans cette exposition qui donne la parole aux habitants.

Musée de Salagon
04300 Mane
04 92 75 70 50
www.musee-de-salagon.com


25 - Doubs

► Le 4 mars

"LA NUIT DE LA CHOUETTE"

Cette année encore, la LPO et la Saline royale organisent la Nuit de la chouette. Ateliers de découverte, observation sur le terrain et  pot de l’amitié à partager en famille ou entre amis.
De 18h à 21h30, sans réservation. Entrée gratuite.

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
03 81 54 45 13
www.salineroyale.com


► Du 5 mai au 5 novembre

EXPOSITION
"LE MONDE DE FOLON"

Hommage à Jean-Michel Folon (1934/2005), artiste belge à la création hybride et poétique représentant les grands maux de la société contemporaine. L’exposition à la Saline royale présentera plus de 200 œuvres issues de la Fondation Folon (affiches, dessins, sculptures…).

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
03 81 54 45 13
www.salineroyale.com


29 - Finistère

Jusqu'au 5 mars 2023

EXPOSITION
"VOYAGE EN TERRES AUSTRALES - CROZET & KERGUELEN 1772-2022"

Aujourd’hui, les archipels de Crozet et Kerguelen sont protégés par une réserve naturelle et élevés au rang de patrimoine mondial de l’UNESCO. Cet anniversaire est l’opportunité de raconter l’histoire de ces terres australes françaises à travers une exposition rassemblant objets et documents inédits.

Musée national de la Marine
Château de Brest
Rue du château 
29200 Brest
02 98 22 12 39
www.musee-marine.fr/brest


Les 6, 7 & 8 mai 2023

"LES JOURNÉES ROMAINES DE NÎMES, VERCINGÉTORIX

Grand spectacle historique. Plongez dans l’Histoire ! Dans les Arènes de Nîmes, 520 figurants venus de toute l’Europe vous font revivre l’histoire de Vercingétorix.
De Gergovie à Alesia, au plus près de la réalité historique, revivez les plus grandes batailles de la Guerre des Gaules qui opposa le légendaire chef gaulois au grand Jules César. Spectacles à 15h30.

Boulevard des Arènes
30000 Nîmes
04 66 21 82 56
www.arenes-nimes.com


34 - Hérault

Jusqu'au 19 mars 2023

EXPOSITION
"PAYSAGES DE COROT À SIMA"

Découvrez près de deux siècles d’art, deux siècles de perception de la nature, et deux siècles de vues à couper le souffle.
Des côtes de Normandie aux forêts du sud de la France, des terres alsaciennes aux pins des landes, découvrez notre pays à travers le regard des plus grands artistes des siècles derniers.

Musée de Lodève
Square George Auric
34700 Lodève
04 67 88 86 10
www.museedelodeve.fr


35 - Ille et Vilaine

► Jusqu'au 3 septembre 2023

EXPOSITION
"RACES BRETONNES : UNE HISTOIRE BIEN VIVANTE"

Vache Bretonne pie noir, mouton d'Ouessant et autres poule Coucou de Rennes s'invitent dans la salle d'exposition de l'Écomusée de la Bintinais !
Des œuvres d'art, des collections techniques et ethnographiques ainsi qu'une riche iconographie accompagnent cette plongée à la découverte des races bretonnes, emblèmes d'une histoire et d'un patrimoine bien vivants !

Écomusée de la Bintinais
Route de Châtillon-Sur-Seiche
35200 Rennes
02 99 51 38 15
www.ecomusee-rennes-metropole.fr


39 - Jura

► Du 4 février au 4 mars 

EXPOSITION
"ARTISANS, PASSEURS DE SAVOIR-FAIRE"

L'exposition vous emmène à la découverte des techniques, des défis et du parcours de 18 artisans formateurs, membres du réseau de l’Atelier des savoir-faire. 
Ainsi, les métiers de muretier, peintre sur soie, tailleur de pierre, sculpteur sur bois, céramiste... seront présenté à travers le regard de chaque artisan.
L’Atelier des savoir-faire propose pour chaque maîtrise exposée, des stages de formation tout au long de l’année.

L’Atelier des savoir-faire
1 Grand’Rue
39170 Ravilloles
03 84 42 65 06
www.atelierdessavoirfaire.fr


Jusqu'au 5 novembre 2023

EXPOSITION
"L'OURS DANS LA BIODIVERSITÉ POLAIRE"

Embarquez dans un voyage naturaliste au milieu des glaces, sur la piste de l’ours. A travers cette exposition, c’est la biodiversité polaire qui est mise à l’honneur.

Espace des Mondes Polaires
46 rue Croix de la Teppe 
39220 Prémanon
03 39 50 80 20
www.espacedesmondespolaires.org


► Du 4 février au 25 mars 2023

EXPOSITION
"BRUITS DE GLACE"

L'exposition "Bruits de glace" est un assemblage d'impressions, de textes et de dessins qui vous fera voyager dans les fjords de Groenland Est, lieux sillonnés en voiliers par Sarah Bovet en 2019.

Espace des Mondes Polaires
46 rue Croix de la Teppe 
39220 Prémanon
03 39 50 80 20
www.espacedesmondespolaires.org


73 - Savoie

Du 6 au 17 février 

ATELIERS
"L'EAU ET LES ANIMAUX LACUSTRES"

Pour ces vacances d'hiver Aqualis propose, à travers des ateliers où l'expérience scientifique parlera avec la création artistique, un programme autour de 2 grands thèmes : l'eau et la biodiversité.

Aqualis
52 esplanade Jean Murguet
73100 Aix-les-Bains
04 79 70 64 69
aqualis-lacdubourget.fr


62 - Pas-de-Calais

► Du 4 au 19 février

EXPOSITION 
"HÉRITAGE DES TEMPLIERS"

Le musée Bruno-Danvin de Saint Pol sur Ternoise offre son espace d’exposition à Daciana Pszota. L’artiste participe à diverses expositions collectives en Italie et en Roumanie.
Inspirée par l'histoire et la spiritualité, ses émotions personnelles s'expriment aussi dans ses œuvres.

Musée municipal Bruno Danvin
Rue Oscar Ricque
62130 Saint-Pol-sur-Ternoise
03 21 04 56 25 / 07 89 08 15 64 
www.saintpolsurternoise.fr


74 - Haute-Savoie

► A partir du 4 février

ACRO'AVENTURES REIGNIER
UN SITE MULTI-ACTIVITÉS ACCESSIBLE À TOUS

Le parcours de Reignier ouvrira du 4 au 19 février tous les jours, puis restera ouvert les mercredis et week-end jusqu'au samedi 1er avril (début de la grande saison).

Acro'Aventures Reignier
Route des Rocailles
74930 Reignier
06 43 16 27 59
www.reignier.acro-aventures.com


75 - Paris

Jusqu'au 25 février 2023

EXPOSITION
"CLEMENCEAU ET LES PHOTOGRAPHES DE L’INTIME"

Le parcours de l’exposition-focus suit les premiers pas de Clemenceau devant l’objectif de son père et, plus tard, en politique, sous l’œil de son ami Félix Nadar rencontré durant la Commune.
L’exposition- se clôture par des photographies de famille immortalisant les moments de bonheur et de complicité avec ses enfants et petits-enfants.

Musée Clemenceau
8 rue Benjamin Franklin,
75116 Paris
01 45 20 53 41
https://musee-clemenceau.fr


77 - Seine et Marne

Du 4 février au 5 mars

PARROT WORLD
"CARNAVAL DE RIO"

Finis les congés d'hiver pour le parc! Une nouvelle saison débute à Parrot World le samedi 4 février 2023 sur le thème du Carnaval de Rio avec plein d' animations. Au programme : ateliers maquillage, masques, coloriages, parade musicale...

Parrot World
Route de Guérard
77580 Crécy-la-Chapelle
01 86 70 06 84
www.parrotworld.fr

Lieux:

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