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Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol
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Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol Actualités

Une nouvelle catégorie d’antibiotiques découverte dans le sol

Une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale, la sécurité alimentaire et le développement. C’est ainsi que l’Organisation Mondiale de la Santé qualifie la résistance aux antibiotiques qu’ont développé certaines bactéries, favorisée par l’utilisation extensive et parfois inappropriée de ces médicaments. Une course s’est engagée pour développer de nouveaux antibiotiques. Dans cette lutte, l’équipe de Sean Brady, de l’université Rockefeller à New York, vient de découvrir dans le sol une nouvelle catégorie d’antibiotiques qui s’est révélée efficace contre certaines souches résistantes aux antibiotiques existants.

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, les antibiotiques permettent de traiter des infections bactériennes comme les pneumonies, les otites, les septicémies ou les infections urinaires. Une large part des antibiotiques utilisés vient de substances produites par des bactéries ou des champignons cultivés en laboratoire. Cependant, les chercheurs ne savent cultiver qu’une petite fraction des bactéries, et seule une petite partie des composés chimiques produits par ces bactéries est connue. Or, on trouve dans le sol au moins 1 000 espèces bactériennes différentes par gramme. Une manne encore largement inexplorée qui recèle peut-être les antibiotiques qui sauveront des millions de vies demain.

Sean Brady et ses collègues ont mis au point une technique pour fouiller le génome de toutes les bactéries (ou metagénome) contenu dans près de 2 000 échantillons de sols récoltés à travers les États-Unis afin de trouver de nouveaux antibiotiques. L’équipe a ciblé des séquences caractéristiques de composés dont les propriétés antibiotiques fonctionnent seulement en présence d’ions calcium. La daptomycine est un antibiotique de cette classe, prescrit notamment contre les infections à staphylocoque doré.

« Ce qui fait l’originalité de cette étude, c’est que l’équipe a ciblé la synthèse d’une certaine famille d’antibiotiques dans le métagénome, sans les rechercher chez certaines espèces de bactéries en particulier et sans s’attacher à savoir si ces dernières seraient cultivables », explique Philippe Glaser, responsable de l’unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques de l’institut Pasteur.

Cette approche a permis aux chercheurs d’identifier une classe de molécules antibiotiques encore non répertoriées, dont l’abondance suggère qu’elles jouent un rôle important. Ils ont baptisé ces molécules malacidines. L’équipe a ensuite reconstitué les séquences génétiques impliquées dans la synthèse de la malacidine et ont fait produire les enzymes de synthèse de la malacidine par une bactérie Streptomyces, facile à cultiver. Puis ils ont testé la malacidine sur des rats infectés par le redoutable staphylocoque doré résistant à la méticilline (SARM). Le traitement s'est révélé efficace et le staphylocoque n’a en outre développé aucune résistance lors de ces expériences.

« Toutefois, la malacidine n’est efficace que contre les bactéries dites à Gram positif », modère Philippe Glaser. « Celles-ci sont classées dans la catégorie 2 (« Priorité élevée ») de la liste des bactéries résistantes pour lesquelles il est urgent de trouver de nouveaux antibiotiques, publiée il y a un an par l’OMS. Les bactéries de la catégorie 1 (« Priorité critique ») sont à Gram négatif. »

Il faudra plusieurs années avant que les malacidines fassent une éventuelle entrée sur le marché des médicaments. Mais la course contre l’antibiorésistance se poursuit et il y a urgence. D’après un rapport cité par les auteurs de l’étude, « en l’absence de nouvelles thérapies, on estime que les taux de mortalité dus aux infections non curables pourraient être multipliés par dix d’ici 2050 ».


Source : Pour la science
Crédit : Shutterstock.com/Julija Sapic

Le sol est riche en bactéries qui produisent, peut-être, les antibiotiques de demain.

LE GUIDE Naturellement

Agenda . . .

01 - Ain

Du 30  août au 13 septembre

CONCERTS
"LES MUSICALES DU PARC DES OISEAUX"

Des artistes engagés en faveur de la protection de l’environnement et des musiciens de légende viendront fêter les 50 ans du Parc des Oiseaux.
Paul Personne - Zazie - Paolo Comte - Daniel Guichard - Vitaa & Slimane - The Dire Straits Expérience - Ibrahim Maalouf - Maxime Le Forestier - Yannick Noah - Louis Bertignac - Gauvin Sers - La Rue Ketanou.

Parc des Oiseaux
01330 Villars Les Dombes
04 74 98 05 54
www.parcdesoiseaux.com


09 - Ariège

Le 8 avril

BALADE
"SUR LA TRACE DES TRACES…"

Nous vous proposons une petite balade sur les hauteurs de Saint-Lizier. Nous partirons ensemble à la recherche de traces et d’indices de présence de chevreuils, sangliers et autres habitants des environs. Pour clore la promenade, nous prendrons un bon goûter maison dans ce joli cadre. Sur réservation.

Au Pays des Traces
Ferme de Miguet
09190 Saint-Lizier    
05 61 66 47 98
www.paysdestraces.fr


13 - Bouches du Rhône

Du 11 au 19 juin

BALADES EN MER
CONGRÈS MONDIAL DE LA NATURE DE L’UICN

Lors de ce rendez vous, des balades en mer à bord de l'Hélios, la seule vedette à passagers hybride de la compagnie Marseillaise ICARD MARITME, seront organisées par : Le parc National de la Côte Bleue : 10 juin - Le conservatoire du littoral : 11 & 16 juin - Le parc National des Calanques : 15 & 20 juin.

1 quai Marcel Pagnol
13007 Marseille
04 91 330 329
www.iucncongress2020


22 - Côtes d'Armor

Le 13 mars

CONFÉRENCE & SORTIE NATURE
"26ÈME NUIT DE LA GRENOUILLE"

Après une présentation dans la salle pédagogique du château, on enfile ses bottes et on sort du château pour 1h d'écoute et de découverte des batraciens. Les habitués pensent à prendre une lampe de poche et des vêtements adaptés à la météo… Gratuit, sur réservation.

Château de la Hunaudaye
22270 Plédéliac
02 96 34 82 10
www.la-hunaudaye.com


Du 15 décembre au 15 mars

EXPOSITION
"FRONDAISONS"
La fabrique d’un maquis de l’Argoat

Le pôle de l'Étang-Neuf présente l'oeuvre de Sophie Zénon, "Frondaisons", la fabrique de l'image d'un maquis de l'Argoat, une exposition de photographies et de vidéos.

Pôle de l'Étang-Neuf
22480 Saint-Connan
02 96 47 17 66
www.etangneufbretagne.com


25 - Doubs

Du 15 février au 3 mai 2020

EXPOSITION
"GEORGES FESSY ET LA PHOTOGRAPHIE"

Exposition en coproduction avec le Familistère de Guise. Georges Fessy et la photographie est une rétrospective présentée à travers plus d’une centaine de photographies qui traduit la diversité d’une vie de photographe : paysages, portraits, natures mortes, objets d’art, vues d’architectures.

Saline royale
Grande Rue
25610 Arc et Senans
www.salineroyale.com


30 - Gard

Jusqu'au 8 mars

EXPOSITION
« FEU », l’expo brûlante de la rentrée au Pont du Gard

FEU conçue par Universcience qui propose d’explorer la thématique de la maîtrise du feu par l’humain. Accessible dès 9 ans, cette exposition rassemble des installations audiovisuelles, des dispositifs multimédia et des expériences interactives ainsi que de nombreux objets visant à enrichir la connaissance des visiteurs et à déconstruire les idées reçues.

Site du Pont du Gard
La Bégude
400 route du Pont du Gard
30210 Vers-Pont-du-Gard
04 66 37 50 99
www.pontdugard.fr


39 - Jura

Du 20 janvier au 2 avril

ATELIERS
"L’ŒIL ET LA MAIN"

Le Musée de la Lunette organise  une visite de l’exposition temporaire « Les lunettes en voient de toutes les couleurs ». Les enfants découvriront l’utilisation de la couleur en lunetterie, ses principes et surtout son design inspirant ! Ils participeront par la suite à un atelier artistique animé par l’une de nos artistes plasticiennes. Cet atelier est à destination des scolaires, de la maternelle au collège.

Musée de la Lunette
Place Jean Jaurès
39400 Morez - Hauts de Bienne
03 84 33 39 30
www.musee-lunette.fr


50 - Manche

Du 8 février au 24 mai

EXPOSITION DE PHOTOGRAPHIES
"LA HAGUE : A L’EPREUVE DU TEMPS"

De vallées encaissées en roches mystérieuses, du littoral déchiqueté aux champs quadrillés de murets, le regard d’Antoine Soubigou s’est posé sur une Hague intemporelle et tourmentée.

Manoir du Tourp
Omonville-la-Rogue
50440 La Hague  
02 33 01 85 89
www.letourp.com


Du 4 avril au 1er novembre

EXPOSITION PHOTOGRAPHIQUE
"VIE SAUVAGE EN COTENTIN"

Une exposition pour les curieux de nature mais aussi pour les amateurs de belles images... L’association "Regards" basée à Cormelles-le-Royal dans le Calvados rassemble des photographes naturalistes, passionnés d’image et de nature.

Manoir du Tourp
Omonville-la-Rogue
50440 La Hague  
02 33 01 85 89
www.letourp.com


62 - Pas-de-Calais

Avril

ATELIERS
J DUBOIS HORTICULTEUR

♦Atelier "le compost" : réalisez votre compost simplement. Le 20 avril de 18h à 20h.
♦Atelier "réaliser un abri à insectes" : on lève le voile sur les insectes qui peuplent nos jardins. Le 22 avril de 14h30 à 16h45.
♦Printemps des possibles - Festival nature, environnement et ESS : nature, local, partage, coopératif. Les 25 et 26 avril.

J Dubois Horticulteur
244 rue de l’Université
62400 Béthune
03 21 57 59 01
www.j-dubois.fr


63 - Puy-de-Dôme

Janvier et février

"CLASSE NEIGE A PETITS PRIX"

Au Centre des Volcans propose un passeport Évasion Glacée à petits prix pour les derniers créneaux disponibles en janvier et février 2020.Venez découvrir les volcans sous la neige...

Au Centre des Volcans
Rue du Frère Genestier
63230 Pontgibaud
04 73 68 18 18 / 06 21 30 79 36
www.au-centre-des-volcans.fr


De janvier à mars

SEJOURS SCOLAIRES
"LES 4 ÉLÉMENTS" et "L'AUVERGNE DES NEIGES"

Des tarifs imbattables sur les séjours scolaires pour les mois de janvier, février et mars 2020 ! Séjours à réserver rapidement.

.Au Centre des Volcans
Rue du Frère Genestier
63230 Pontgibaud
04 73 68 18 18 / 06 21 30 79 36
www.au-centre-des-volcans.fr


68 - Haut-Rhin

Le 8 mars

22ÈME SALON OURS ET POUPÉES

Le musée rouvrira ses portes le dimanche 8 mars avec le 22ème Salon Ours & Poupée qui aura lieu à la M.A.B. de Soultz, avec un atelier de fabrication « Chapeaux et sacs poupées en feutre laine », une exposition sur les poupées Raynal ainsi que sur les poupées américaines des années 1930 à nos jours.

La Nef des Jouets
12 rue Jean Jaurès
68360 Soultz
03 89 74 30 92
www.ville-soultz.fr


71 - Saône et Loire

► Du 4 avril au 1er novembre

EXPOSITION
"BÊTISE ET BALIVERNES, IDÉES REÇUES SUR LA NATURE"

« les chauves-souris s'accrochent dans les cheveux » ; « les grenouilles sont vertes et les crapauds marron » ; « les moustiques préfèrent les peaux sucrées… », autant d’idées reçues et de fausses informations qui ont souvent la vie dure ! Une scénographie originale et les illustrations humoristiques de Roland Garrigue raviront aussi bien les petits que les grands !

Centre EDEN
26 rue de l’Eglise
71290 Cuisery
03 85 27 08 00
www.centre-eden71.fr


76 - Seine maritime

Les 25 et 26 avril

SALON INTERNATIONAL DE LA LAINE

Accueillant plus de 40 exposants internationaux, ce salon est une première en Normandie. Fils, patrons, kits, échanges, de quoi mettre en valeur le travail artisanal, explorer les savoir-faire.

Château de Miromesnil
76550 Tourville-sur-Arques
02 35 85 02 80
www.chateaumiromesnil.com

Lieux:

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